Population-Level Analyses Indirectly Reveal Cryptic Sex and Life History Traits of Pseudoperkinsus tapetis (Ichthyosporea, Opisthokonta): A Unicellular Relative of the Animals
Notice bibliographique
Résumé
We use population genetics to detect the molecular footprint of a sexual cycle, of a haploid vegetative state, and of lack of host specificity in Pseudoperkinsus tapetis, a marine unicellular relative of the animals. Prior to this study, complete life cycles were not known for any of the unicellular lineages sharing common ancestry with multicellular animals and fungi. We established the first collection of conspecific cultures of any member from the unicellular opisthokont lineage ichthyosporea, isolating 126 cultures of P. tapetis from guts of marine invertebrates ranging from clams to sea cucumbers. We sequenced fragments of the elongation factor alpha-like (EFL) and heat-shock protein 70 (HSP70) genes for a subset of our isolates. Absence of heterozygotes from the EFL locus in 52 isolates provided evidence for haploidy. Phylogenetic incongruence and a lack of support for linkage between two loci from 34 sequenced isolates signified a history of recombination consistent with a sexual cycle. Shared haplotypes in different invertebrate species showed that P. tapetis was not host specific. Based on estimates of the frequency of sex and on observations of cultures, we propose that P. tapetis is transmitted between hosts via asexual endospores. New protists are continually being discovered, and, as this study illustrates, analysis of culturable collections from natural habitats can transform a species from a near unknown to a model system for better understanding the evolution of life histories.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».