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Enregistrement W2118141325 · doi:10.1186/s13630-015-0017-x

Non-invasive sources of cells with primary cilia from pediatric and adult patients

2015· article· en· W2118141325 sur OpenAlexaff
Henry Ajzenberg, Gisela G. Slaats, Marijn F. Stokman, Heleen H. Arts, Ive Logister, Hester Y. Kroes, Kirsten Y. Renkema, Mieke M. van Haelst, Paulien A. Terhal, Iris A.L.M. van Rooij, Mandy G. Keijzer‐Veen, Nine Knoers, Marc R. Liliën, Michael A.S. Jewett, Rachel H. Giles

Notice bibliographique

RevueCilia · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversity of TorontoWestern University
Organismes subventionnairesUniversitair Medisch Centrum UtrechtNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNierstichting
Mots-clésCiliopathiesCiliumCiliopathyBiologyEx vivoCiliogenesisPrimary ciliary dyskinesiaPathologyCell biologyBioinformaticsIn vivoMedicineInternal medicinePhenotypeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Ciliopathies give rise to a multitude of organ-specific pathologies; obtaining relevant primary patient material is useful for both diagnostics and research. However, acquisition of primary ciliated cells from patients, particularly pediatric patients, presents multiple difficulties. Biopsies and blood samples are invasive, and patients (and their parents) may be reluctant to travel to medical centers, especially for research purposes. We sought to develop non-invasive methods of obtaining viable and ciliated primary cells from ciliopathy patients which could be obtained in the home environment. FINDINGS: We introduce two methods for the non-invasive acquisition of primary ciliated cells. In one approach, we collected spontaneously shed deciduous (milk) teeth from children. Fibroblast-like cells were observed after approximately 2 weeks of culture of fragmented teeth. Secondly, urine samples were collected from children or adults. Cellular content was isolated and after approximately 1 week, renal epithelial cells were observed. Both urine and tooth-derived cells ciliate and express ciliary proteins visible with immunofluorescence. Urine-derived renal epithelial cells (URECs) are amenable to 3D culturing, siRNA knockdown, and ex vivo drug testing. CONCLUSIONS: As evidence continues to accumulate showing that the primary cilium has a central role in development and disease, the need for readily available and ciliated patient cells will increase. Here, we introduce two methods for the non-invasive acquisition of cells with primary cilia. We believe that these cells can be used for further ex vivo study of ciliopathies and in the future, for personalized medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,359
Score d'incertitude au seuil0,386

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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