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Enregistrement W2118173172 · doi:10.1002/cmdc.201500114

Metabolic Instability of Cyanothiazolidine‐Based Prolyl Oligopeptidase Inhibitors: a Structural Assignment Challenge and Potential Medicinal Chemistry Implications

2015· article· en· W2118173172 sur OpenAlexafffund
Paolo Schiavini, Joshua Pottel, Nicolas Moitessier, Karine Auclair

Notice bibliographique

RevueChemMedChem · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesAstraZeneca
Mots-clésOligopeptidaseChemistryMetabolic stabilityStructural biologyComputational biologyBiochemistryStereochemistryBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As part of the development of cyanothiazolidine-based prolyl oligopeptidase inhibitors, initial metabolism studies suggested multiple sites of oxidation by P450 enzymes. Surprisingly, in-depth investigations revealed that epimerization at multiple stereogenic centers was responsible for the conversion of the single primary metabolite into a panel of secondary metabolites. The rapid isomerization of all seven detected molecules precluded the use of NMR spectroscopy or X-ray crystallography for complete structural determination, presenting an interesting structure elucidation challenge. Through a combination of LC-MS analysis, synthetic work, deuterium exchange studies, and computational predictions, we were able to characterize all metabolites and to elucidate their dynamic behavior in solution. In the context of drug development, this study reveals that cyanothiazolidine moieties are problematic due to their rapid P450-mediated oxidation and the unpredictable stability of the corresponding metabolites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,900

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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