BRCA1:185delAG found in the San Luis Valley probably originated in a Jewish founder: Table 1.
Notice bibliographique
Résumé
Three BRCA1/2 mutations ( 185delAG and 5382insC in BRCA1 , and 617delT in BRCA2 ) are present in about 2.5% of the Ashkenazi Jewish population,1–4 and in 10–12% of Ashkenazi Jewish women with breast cancer.5 Mutations that become common in a population are often explained by the presence of a “founder effect”. This effect tends to exist when a population is established by a small group of ancestors. The members of the group are called founders and become isolated from the original population from which they are derived on account of geographical, cultural, or linguistic barriers. If this isolation persists, genetic drift can cause disease producing alleles present in the founders to become more frequent in subsequent generations. The San Luis Valley (SLV) is a large, isolated valley situated on the border between New Mexico and Colorado. The first settlers were Spaniards of the de Onate expedition in 1598, but today it has an admixed population descended from Native Americans, West Africans, and Europeans.6 A previous study in Colorado of breast cancer patients with SLV ancestry revealed the presence of a hereditary breast cancer mutation, BRCA1 : 185delAG .7 Many of these individuals came from areas of Spanish settlement in what is now northern New Mexico, an area known to have had a number of Spanish settlers with Jewish heritage. This population remained fairly coherent until the mid-1900s, which would have allowed the fixation of certain mutations in the population through the founder effect.8 The 185delAG mutation (c.68_69del2) is a founder mutation in the Ashkenazi Jewish population and is the most common BRCA1 mutation in this population, with a frequency of 1%.2,3 Markers flanking this mutation have conserved alleles among Ashkenazi carriers, allowing for the construction of a distinct, linked haplotype.4 In this …
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».