Quantitative evolution of transposable and satellite DNA sequences in <i>Picea</i> species
Notice bibliographique
Résumé
Clones containing tandemly arranged repeats belonging to two distinct sequence families, (i) PAG004P22F (2F) and PAG004E03C (3C) or (ii) Ty3/gypsy- (8R; PAG004B08R) and Ty1/copia-like sequences (9R; PAG007F19R), were selected from a randomly sheared total genomic DNA library of Picea abies . The inserts were used as probes in dot-blot hybridizations to genomic DNA of P. abies, Picea orientalis , Picea pungens , and Picea pungens var. glauca. All these entities are diploid and share the same chromosome number (2n = 24), but the genome sizes differ largely. The redundancy (copy number per 1C DNA) of sequences related to each probe varied greatly between the genomes. No significant correlation was found between the genome size and the copy number of sequences in any family. The quantitative ratios varied greatly (in each genome) between the two families of satellite DNA, between the sequences that represented copia or gypsy retrotransposons, and between tandemly arranged sequences and retroelements as a whole, suggesting that there is no common factor that controls the quantitative evolution of repeats belonging to different sequence families during speciation in Picea.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».