MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2118207504 · doi:10.1093/jxb/eru524

The FRK1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase (MAPKKK) from Solanum chacoense is involved in embryo sac and pollen development

2015· article· en· W2118207504 sur OpenAlexafffund
Édith Lafleur, Christelle Kapfer, Valentin Joly, Yang Liu, Faïza Tebbji, Caroline Daigle, Madoka Gray‐Mitsumune, Mario Cappadocia, André Nantel, Daniel P. Matton

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensMontreal Clinical Research InstituteUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyMegasporeOvuleMicrosporePollen tubeCell biologyGametophyteProtein kinase AEmbryoBotanyKinasePollenPollinationStamen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fertilization-related kinase 1 (ScFRK1), a nuclear-localized mitogen-activated protein kinase kinase kinase (MAPKKK) from the wild potato species Solanum chacoense, belongs to a small group of pMEKKs that do not possess an extended N- or C-terminal regulatory domain. Initially selected based on its highly specific expression profile following fertilization, in situ expression analyses revealed that the ScFRK1 gene is also expressed early on during female gametophyte development in the integument and megaspore mother cell and, later, in the synergid and egg cells of the embryo sac. ScFRK1 mRNAs are also detected in pollen mother cells. Transgenic plants with lower or barely detectable levels of ScFRK1 mRNAs lead to the production of small fruits with severely reduced seed set, resulting from a concomitant decline in the number of normal embryo sacs produced. Megagametogenesis and microgametogenesis were affected, as megaspores did not progress beyond the functional megaspore (FG1) stage and the microspore collapsed around the first pollen mitosis. As for other mutants that affect embryo sac development, pollen tube guidance was severely affected in the ScFRK1 transgenic lines. Gametophyte to sporophyte communication was also affected, as observed from a marked change in the transcriptomic profiles of the sporophytic tissues of the ovule. The ScFRK1 MAPKKK is thus involved in a signalling cascade that regulates both male and female gamete development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,835

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Experimental BotanyMême sujetPlant Reproductive BiologyTravaux en français237 207