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Enregistrement W2118339155 · doi:10.1111/j.1439-0531.2012.02069.x

Factors Affecting Oocyte and Embryo Transcriptomes

2012· review· en· W2118339155 sur OpenAlexafffund
Marc‐André Sirard

Notice bibliographique

RevueReproduction in Domestic Animals · 2012
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésOocyteTranscriptomeBiologyBlastocystEmbryoAndrologyCell biologyMeiosisEmbryonic stem cellFollicular phaseOvarian follicleEmbryogenesisGeneticsGene expressionGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The most important factor affecting the oocyte and early embryo transcriptome is the legacy from the follicular environment prior to meiotic resumption. Up to the 8-cell stage, the oocyte responds to maternal instructions stored before resumption of the meiotic division. Recent evidence suggests that properly prepared or programmed oocytes (in vivo) can achieve close to 100% blastocyst rates in standard in vitro conditions/media. Therefore, the optimal oocyte requires perfect follicular timing and differentiation, but the intra-oocyte mechanisms involved in such preparation are not completely understood. In addition, the influence of maternal mRNA storage and degradation, as well as the length of the poly A tail that influences the general pattern of the oocyte/early embryo transcriptome, is an important factor. Several hypotheses have been put forth to explain the depletion of the maternal store, including the potential role of microRNA (miRNA) in this process. The activation of the embryonic genome could be dependent on, or associated with, the process of maternal mRNA degradation, but obviously other functions are being activated at this critical time point. This review will focus on the period from full-size oocytes to the eight-cell stage and will summarize the impact of the important factors, that is, follicle, maternal RNA storage and embryonic genome activation, on the transcriptome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,134
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations98
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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