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Enregistrement W2118356664 · doi:10.1074/jbc.m113.455832

Calcineurin Regulates Nuclear Factor I Dephosphorylation and Activity in Malignant Glioma Cell Lines

2013· article· en· W2118356664 sur OpenAlexaff
Miranda Brun, Darryl Glubrecht, Shairaz Baksh, Roseline Godbout

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDephosphorylationCalcineurinCancer researchGliomaCell cultureChemistryCell biologyBiologyPhosphorylationInternal medicineMedicineGeneticsPhosphataseTransplantation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malignant gliomas (MG), including grades III and IV astrocytomas, are the most common adult brain tumors. These tumors are highly aggressive with a median survival of less than 2 years. Nuclear factor I (NFI) is a family of transcription factors that regulates the expression of glial genes in the developing brain. We have previously shown that regulation of the brain fatty acid-binding protein ( B-FABP ; FABP7 ) and glial fibrillary acidic protein ( GFAP ) genes in MG cells is dependent on the phosphorylation state of NFI, with hypophosphorylation of NFI correlating with GFAP and B-FABP expression. Importantly, NFI phosphorylation is dependent on phosphatase activity that is enriched in GFAP/B-FABP+ve cells. Using chromatin immunoprecipitation, we show that NFI occupies the GFAP and B-FABP promoters in NFI-hypophosphorylated GFAP/B-FABP+ve MG cells. NFI occupancy, NFI-dependent transcriptional activity, and NFI phosphorylation are all modulated by the serine/threonine phosphatase calcineurin. Importantly, a cleaved form of calcineurin, associated with increased phosphatase activity, is specifically expressed in NFI-hypophosphorylated GFAP/B-FABP+ve MG cells. Calcineurin in GFAP/B-FABP+ve MG cells localizes to the nucleus. In contrast, calcineurin is primarily found in the cytoplasm of GFAP/B-FABP-ve cells, suggesting a dual mechanism for calcineurin activation in MG. Finally, our results demonstrate that calcineurin expression is up-regulated in areas of high infiltration/migration in grade IV astrocytoma tumor tissue. Our data suggest a critical role for calcineurin in NFI transcriptional regulation and in the determination of MG infiltrative properties. Background: Nuclear factor I (NFI) phosphorylation controls the expression of glial genes associated with migration. Results: NFI is dephosphorylated and activated by a cleaved form of calcineurin in malignant glioma cells. Conclusion: NFI transcriptional activity in malignant glioma is regulated in part by calcineurin. Significance: Regulation of NFI by calcineurin provides a novel approach to control the expression of genes associated with migration/infiltration in malignant glioma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,389

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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