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Enregistrement W2118404745 · doi:10.1136/jclinpath-2012-201376

Colorectal cancer in a 9-year-old due to combined <i>EPCAM</i> and <i>MSH2</i> germline mutations: case report of a unique genotype and immunophenotype

2013· letter· en· W2118404745 sur OpenAlexaff
Hector Li-Chang, David K. Driman, Helen Levin, Victoria Mok Siu, Nancy L Scanlan, Kathleen Buckley, A. Elizabeth Cairney, Peter Ainsworth

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2013
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensGrand River HospitalWestern UniversityLondon Health Sciences CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLynch syndromeEpithelial cell adhesion moleculeMLH1MSH6MSH2PMS2Germline mutationCancer researchBiologyNeurofibromatosisColorectal cancerCancerGermlinePathologyMedicineMutationDNA mismatch repairGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lynch syndrome (LS) typically arises in the setting of a heterozygous germline mutation in one of the DNA mismatch repair (MMR) genes ( MLH1 , MSH2 , MSH6 , PMS2 ). Rarely, LS can also arise due to germline deletion of the 3′ region of the epithelial cell adhesion molecule ( EPCAM ) gene, an event that results in silencing of the in cis downstream MSH2 gene in epithelial cells.1 ,2 As with other causes of LS, EPCAM mutations have been associated with increased risk of colorectal and endometrial carcinomas.3 Biallelic MMR mutations (ie, the presence of two defective germline copies of the same MMR gene) result in a different cancer syndrome. Malignancy may occur as early as the first decade, and the most common neoplasms are lymphomas, leukaemias and tumours of the central nervous system (CNS).4 Gastrointestinal carcinomas are also common, and usually arise in the colorectum, with a minority occurring in the small bowel.4 ,5 In one review of patients with gastrointestinal carcinoma with biallelic MMR mutations, the mean age of first cancer diagnosis was 16.4 years (range: 5–28 years), with 55% (16 of 29) of cases presenting in the paediatric setting.4 Patients may also have skin lesions typically associated with neurofibromatosis type 1, such as cafe-au-lait macules and neurofibromas. …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,185
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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