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Enregistrement W2118428601 · doi:10.1128/jvi.06936-11

Modulation of the Myxoma Virus Plaque Phenotype by Vaccinia Virus Protein F11

2012· article· en· W2118428601 sur OpenAlexafffund
Chad R. Irwin, David H. Evans

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMyxoma virusBiologyVirologyVirusPoxviridaeActinRHOAVacciniaOrthopoxvirusMicrofilamentCell biologyCytoskeletonGeneRecombinant DNACellGeneticsSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vaccinia virus (VACV) produces large plaques consisting of a rapidly expanding ring of infected cells surrounding a lytic core, whereas myxoma virus (MYXV) produces small plaques that resemble a focus of transformed cells. This is odd, because bioinformatics suggests that MYXV carries homologs of nearly all of the genes regulating Orthopoxvirus attachment, entry, and exit. So why does MYXV produce foci? One notable difference is that MYXV-infected cells produce few of the actin microfilaments that promote VACV exit and spread. This suggested that although MYXV carries homologs of the required genes (A33R, A34R, A36R, and B5R), they are dysfunctional. To test this, we produced MYXV recombinants expressing these genes, but we could not enhance actin projectile formation even in cells expressing all four VACV proteins. Another notable difference between these viruses is that MYXV lacks a homolog of the F11L gene. F11 inhibits the RhoA-mDia signaling that maintains the integrity of the cortical actin layer. We constructed an MYXV strain encoding F11L and observed that, unlike wild-type MYXV, the recombinant virus disrupted actin stress fibers and produced plaques up to 4-fold larger than those of controls, and these plaques expanded ∼6-fold faster. These viruses also grew to higher titers in multistep growth conditions, produced higher levels of actin projectiles, and promoted infected cell movement, although neither process was to the extent of that observed in VACV-infected cells. Thus, one reason for why MYXV produces small plaques is that it cannot spread via actin filaments, although the reason for this deficiency remains obscure. A second reason is that leporipoxviruses lack vaccinia's capacity to disrupt cortical actin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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