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Enregistrement W2118496272 · doi:10.1158/1055-9965.epi-11-0888

Common Variants at the 19p13.1 and <i>ZNF365</i> Loci Are Associated with ER Subtypes of Breast Cancer and Ovarian Cancer Risk in <i>BRCA1</i> and <i>BRCA2</i> Mutation Carriers

2012· article· en· W2118496272 sur OpenAlexfundno aff
Fergus J. Couch, Mia M. Gaudet, Antonis C. Antoniou, Susan J. Ramus, Karoline Kuchenbaecker, Penny Soucy, Jonathan Beesley, Xianshu Wang, Tomas Kirchhoff, Lesley McGuffog, Daniel Barrowdale, Andrew Lee, Sue Healey, Olga M. Sinilnikova, Irene L. Andrulis, Hilmi Özçelik, Anna Marie Mulligan, Mads Thomassen, Anne‐Marie Gerdes, Uffe Birk Jensen, Anne‐Bine Skytte, Torben A. Kruse, Maria A. Caligo, Anna von Wachenfeldt, Gisela Barbany, Niklas Loman, Maria Soller, Hans Ehrencrona, Per Karlsson, Katherine L. Nathanson, Timothy R. Rebbeck, Susan M. Domchek, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Katarzyna Jaworska, Katarzyna Durda, Elżbieta Złowocka, Tomasz Huzarski, Tomasz Byrski, Jacek Gronwald, Cezary Cybulski, Bohdan Górski, Ana Osório, M. Durán, María‐Isabel Tejada, Javier Benı́tez, Ute Hamann, Frans B.L. Hogervorst, Theo A. van Os, Flora E. van Leeuwen, Hanne Meijers‐Heijboer, Juul Wijnen, Marinus J. Blok, Marleen Kets, Maartje J. Hooning, Rogier A. Oldenburg, Margreet G.E.M. Ausems, Susan Peock, Debra Frost, Steve D. Ellis, Radka Platte, Elena Fineberg, D. Gareth Evans, Chris Jacobs, Rosalind A. Eeles, Julian Adlard, Rosemarie Davidson, Trevor Cole, Jackie Cook, Joan Paterson, Carole Brewer, Fiona Douglas, Shirley V. Hodgson, Patrick J. Morrison, Lisa Walker, Mary Porteous, Lucy Side, Betsy Bove, Andrew K. Godwin, Dominique Stoppa‐Lyonnet, Marion Fassy-Colcombet, Laurent Castéra, François Cornelis, Sylvie Mazoyer, Mélanie Léoné, Nadia Boutry‐Kryza, Brigitte Bressac–de Paillerets, Olivier Caron, Pascal Pujol, Isabelle Coupier, Capucine Delnatte, Linda Akloul, Henry T. Lynch, Carrie Snyder, Saundra S. Buys, Mary B. Daly, Mary Beth Terry, Wendy K. Chung, Esther M. John, Alexander Miron, Melissa C. Southey, John L. Hopper, David E. Goldgar, Christian F. Singer, Christine Rappaport, Muy‐Kheng M. Tea, Anneliese Fink-Retter, Thomas van Overeem Hansen, Finn C. Nielsen, Aðalgeir Arason, Joseph Vijai, Sohela Shah, Kara Sarrel, Mark E. Robson, Marion Piedmonte, Jack Basil, Wendy S. Rubinstein, John F. Boggess, Katie Wakeley, Amanda E. Toland, Marco Montagna, Simona Agata, Evgeny N. Imyanitov, Claudine Isaacs, Ramūnas Janavičius, Conxi Lázaro, Ignacio Blanco, Lídia Feliubadaló, Joan Brunet, Simon A. Gayther, Paul D.P. Pharoah, Kunle Odunsi, Beth Y. Karlan, Christine Walsh, Edith Oláh, Soo‐Hwang Teo, Patricia A. Ganz, Mary Beattie, Elizabeth J. van Rensburg, Cecelia M. Dorfling, Orland Dı́ez, Ava Kwong, Rita K. Schmutzler, Barbara Wappenschmidt, Christoph Engel, Alfons Meindl, Nina Ditsch, Norbert Arnold, Simone Heidemann, Dieter Niederacher, Sabine Preisler‐Adams, Dorothea Gadzicki, Raymonda Varon-Mateeva, Helmut Deißler, Andrea Gehrig, Christian Sutter, Karin Kast, Britta Fiebig, Wolfram Heinritz, Miguel de la Hoya, Taru Muranen, Heli Nevanlinna, Marc Tischkowitz, Amanda B. Spurdle, Susan L. Neuhausen, Yuan Chun Ding, Noralane M. Lindor, Zachary Fredericksen, V. Shane Pankratz, Paolo Peterlongo, Siranoush Manoukian, Bernard Peissel, Daniela Zaffaroni, Monica Barile, Loris Bernard, Alessandra Viel, Giuseppe Giannini, Liliana Varesco, Paolo Radice, Mark H. Greene, Douglas F. Easton, Georgia Chenevix‐Trench, Kenneth Offit, Jacques Simard

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Cancer InstituteZonMwNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UK
Mots-clésOvarian cancerCancerBreast cancerMutationBRCA2 ProteinMedicineGeneticsOncologyBiologyInternal medicineCancer researchGermline mutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Genome-wide association studies (GWAS) identified variants at 19p13.1 and ZNF365 (10q21.2) as risk factors for breast cancer among BRCA1 and BRCA2 mutation carriers, respectively. We explored associations with ovarian cancer and with breast cancer by tumor histopathology for these variants in mutation carriers from the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2 (CIMBA). METHODS: Genotyping data for 12,599 BRCA1 and 7,132 BRCA2 mutation carriers from 40 studies were combined. RESULTS: We confirmed associations between rs8170 at 19p13.1 and breast cancer risk for BRCA1 mutation carriers [HR, 1.17; 95% confidence interval (CI), 1.07-1.27; P = 7.42 × 10(-4)] and between rs16917302 at ZNF365 (HR, 0.84; 95% CI, 0.73-0.97; P = 0.017) but not rs311499 at 20q13.3 (HR, 1.11; 95% CI, 0.94-1.31; P = 0.22) and breast cancer risk for BRCA2 mutation carriers. Analyses based on tumor histopathology showed that 19p13 variants were predominantly associated with estrogen receptor (ER)-negative breast cancer for both BRCA1 and BRCA2 mutation carriers, whereas rs16917302 at ZNF365 was mainly associated with ER-positive breast cancer for both BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. We also found for the first time that rs67397200 at 19p13.1 was associated with an increased risk of ovarian cancer for BRCA1 (HR, 1.16; 95% CI, 1.05-1.29; P = 3.8 × 10(-4)) and BRCA2 mutation carriers (HR, 1.30; 95% CI, 1.10-1.52; P = 1.8 × 10(-3)). CONCLUSIONS: 19p13.1 and ZNF365 are susceptibility loci for ovarian cancer and ER subtypes of breast cancer among BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. IMPACT: These findings can lead to an improved understanding of tumor development and may prove useful for breast and ovarian cancer risk prediction for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,990

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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