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Enregistrement W2118499190 · doi:10.1186/1757-2215-6-74

The significance of the alteration of 8-OHdG in serous ovarian carcinoma

2013· article· en· W2118499190 sur OpenAlexaff
Xia Xu, Yan Wang, Wenwen Guo, Yiqing Zhou, Chunmei Lv, Xiaoxiang Chen, Kaijiang Liu

Notice bibliographique

RevueJournal of Ovarian Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterGovernment of Jiangsu Province
Mots-clésSerous fluidSerous CystadenomaCarcinogenesisImmunohistochemistryPathologyOvarian cancerMedicineCystadenocarcinomaSerous carcinomaOvarian carcinomaCystadenomaCancer researchCancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Oxidative damage and DNA repair dysfunction are associated with carcinogenesis. 8-OHdG is one of the major oxidative DNA adducts. Present work aims to investigate whether the expression of 8-OHdG and its key repair gene hOGG1 play distinctive role in two types of serous ovarian cancer. MATERIALS AND METHODS: 8-OHdG level in DNA from tumor and matched tumor-adjacent normal tissue in 48 high-grade papillary serous carcinomas (HG-SOC), 24 low-grade papillary serous carcinomas (LG-SOC), 20 serous cystadenomas, and 16 non-tumor control ovaries was tested. The Cox proportional hazards model and the log-rank test were used to assess the associations between the 8-OHdG level in two types of serous cancer and patients' survival. Real-time polymerase chain reaction and protein immunoblot were employed to detect hOGG1 mRNA and protein levels in tumor and adjacent normal tissues. Immunohistochemistry was used to determine the expression of hOGG1 and p53. RESULTS: There was no difference of average 8-OHdG/106dG DNA level either between HG-SOC (27.8 ± 8.9), LG-SOC (25.2 ± 7.4) and benign serous cystadenoma (26.5 ± 7.7, p = 0.35); or between the tumor-adjacent normal tissue of HG-SOC (18.8 ± 5.2), LG-SOC (21.4 ± 6.5), benign serous cystadenoma (20.5 ± 9.1) and non-tumor ovary (21.6 ± 4.9, p = 0.62). The 8-OHdG/106dG level was significantly higher in tumor comparing to that in matched normal tissue adjacent to carcinoma in HG-SOC (1.52 ± 0.52, p = 0.02), but not in LG-SOC or benign serous cystadenoma. Increased level of 8-OHdG in tumor DNA was an independent factor of overall survival in serous ovarian carcinoma upon multivariate analysis (p < 0.01). Increased level of 8-OHdG in tumor DNA indicates poorer overall and progression-free survival durations than counterparts (47.3 vs 105.7 months and 13.5 vs 45.3 months, respectively). Protein levels of hOGG1 were remarkably decreased in HG-SOC (p < 0.01), but not in LG-SOC and serous cystadenoma compared with the tissue adjacent to carcinoma. A positive result on p53 immunostaining was associated with lower hOGG1 expression in HG-SOC (p = 0.04). CONCLUSION: Increased 8-OHdG level and decreased expression of hOGG1 in tumor were found in HG-SOC but not LG-SOC. Increased 8-OHdG level in tumor DNA was significantly associated with poorer overall survival and progression-free survival in serous ovarian carcinoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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