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Enregistrement W2118574779 · doi:10.1183/09031936.00032412

Expression of the nuclear factor-κB inhibitor A20 is altered in the cystic fibrosis epithelium

2012· article· en· W2118574779 sur OpenAlexfundno aff
Catriona Kelly, Mark Williams, Kathryn J. Mitchell, J.S. Elborn, Madeleine Ennis, Bettina Schock

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of California, San FranciscoQueen's UniversityCystic Fibrosis Trust
Mots-clésNFKB1Cell biologyInflammationUbiquitinRespiratory epitheliumBiologyNF-κBTumor necrosis factor alphaEpitheliumReceptorCancer researchSignal transductionMolecular biologyTranscription factorImmunologyGeneBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A20 is a lipopolysaccharide (LPS)-inducible, cytoplasmic zinc finger protein, which inhibits Toll-like receptor-activated nuclear factor (NF)-κB signalling by deubiquitinating tumour necrosis factor receptor-associated factor (TRAF)-6. The action of A20 is facilitated by complex formation with ring finger protein (RNF)-11, Itch and TAX-1 binding protein-1 (TAX1BP1). This study investigated whether the expression of A20 is altered in the chronically inflamed cystic fibrosis (CF) airway epithelium. Nasal epithelial cells from CF patients (F508del homozygous), non-CF controls and immortalised epithelial cells (16HBE14o- and CFBE41o-) were stimulated with LPS. Cytoplasmic expression of A20 and expression of NF-κB subunits were analysed. Formation of the A20 ubiquitin editing complex was also investigated. In CFBE41o-, peak LPS-induced A20 expression was delayed compared with 16HBE14o- and fell significantly below basal levels 12-24 h after LPS stimulation. This was confirmed in primary CF airway cells. Additionally, a significant inverse relationship between A20 and p65 expression was observed. Inhibitor studies showed that A20 does not undergo proteasomal degradation in CFBE41o-. A20 interacted with TAX1BP1, RNF11 and TRAF6 in 16HBE14o- cells, but these interactions were not observed in CFBE41o-. The expression of A20 is significantly altered in CF, and important interactions with complex members and target proteins are lost, which may contribute to the state of chronic NF-κB-driven inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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