MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2118666993 · doi:10.1139/g03-035

Genetics of drought tolerance during seed germination in tomato: inheritance and QTL mapping

2003· article· en· W2118666993 sur OpenAlexvenueno aff
Majid R. Foolad, Li Zhang, P. Subbiah

Notice bibliographique

RevueGenome · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetics and Plant Breeding
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of California, DavisNorth Carolina State University
Mots-clésBiologyGerminationLycopersiconPopulationQuantitative trait locusRestriction fragment length polymorphismHeritabilityMarker-assisted selectionHorticultureGeneticsGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A BC1 population (N = 1000) of an F1 hybrid between a stress-sensitive Lycopersicon esculentum breeding line (NC84173; maternal and recurrent parent) and a germination stress-tolerant Lycopersicon pimpinellifolium accession (LA722) was evaluated for seed germination rate under drought stress (DS) (14% w/v polyethyleneglycol-8000, water potential approximately -680 kPa), and the most rapidly germinating seeds (first 3% to germinate) were selected. The 30 selected BC1 seedlings were grown to maturity and self pollinated to produce BC1S1 progeny seeds. Twenty of the 30 selected BC1S1 progeny families were evaluated for germination rate under DS and their average performance was compared with that of a "nonselected" BC1S1 population of the same cross. Results indicated that selection for rapid germination under DS significantly improved progeny germination rate under DS (selection gain = 19.6%), suggesting a realized heritability of 0.47 for rate of germination under DS in this population. The 30 selected BC1 plants were subjected to restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis, and marker allele frequencies for 119 RFLP markers which spanned 1153 cM of the 12 tomato chromosomes were determined. A distributional extreme marker analysis, which measures statistical differences in marker allele frequencies between a selected and a nonselected population, detected four quantitative trait loci (QTLs) for rate of germination under DS in this population. Of these, two QTLs, located on chromosomes 1 and 9, were contributed by the L. pimpinellifolium donor parent and had larger effects than the other two QTLs, located on chromosomes 8 and 12, which were contributed by the L. esculentum recurrent parent. A few BC1S1 families were identified with all or most of the identified QTLs and with germination rates comparable with that of LA722. These families should be useful for the development of germination drought-tolerant tomato lines using marker-assisted selection (MAS). The overall results indicate that drought tolerance during seed germination in tomato is genetically controlled and potentially could be improved by directional phenotypic selection or MAS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations123
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGenomeMême sujetGenetics and Plant BreedingTravaux en français237 207