Characterization of a Subfamily of Beetle Odorant-binding Proteins Found in Hemolymph
Notice bibliographique
Résumé
In insects, hydrophobic odorants are transported through the sensillar lymph to receptors on sensory neurons by odorant-binding proteins (OBPs). The beetle Tenebrio molitor, which is a pest of stored grain products, produces a set of 12-14-kDa OBP-like proteins in its hemolymph. The structure of one of these proteins and that of a moth pheromone-binding protein have been solved. Both proteins have at least six alpha-helices with an internal, hydrophobic, ligand-binding pocket, but the beetle OBP lacks one of the disulfide bonds immediately adjacent to this pocket. To explore this difference and to sample isoform diversity, T. molitor hemolymph OBPs were fractionated by size-exclusion chromatography and reversed-phase high performance liquid chromatography. Selected fractions were reduced and alkylated, and tryptic peptides were sequenced by tandem mass spectrometry. Partial sequences of 7 different isoforms were obtained and used to clone 9 new cDNAs encoding OBPs with identities from 32 to 99%. The more divergent isoforms have numerous substitutions of hydrophobic residues that presumably alter the shape and specificity of the ligand-binding pocket. These isoforms all lack the same third disulfide bridge and are more similar to one another than to any of the 38 OBPs in Drosophila melanogaster. They have presumably arisen via gene duplication following separation of the major insect orders.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».