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Enregistrement W2119039406 · doi:10.1897/06-295r.1

A predictive quantitative structure-activity relationship model for the photoinduced toxicity of polycyclic aromatic hydrocarbons to<i>Daphnia magna</i>with the use of factors for photosensitization and photomodification

2007· article· en· W2119039406 sur OpenAlexaff
Mark A. Lampi, Jolanta Gurska, Xiaodong Huang, D. George Dixon, Bruce M. Greenberg

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Toxicology and Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDaphnia magnaToxicityEnvironmental chemistryDaphniaChemistryQuantitative structure–activity relationshipBiologyEcologyStereochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are ubiquitous environmental contaminants that readily absorb environmentally relevant solar ultraviolet radiation. On absorption of a photon, photoinduced toxicity of PAHs is manifested through photosensitization and photomodification. Both of these processes occur under environmentally relevant levels of actinic radiation. An empirical quantitative structure-activity relationship model previously developed was explanatory of photoinduced toxicity of 16 PAHs in Lemna gibba (duckweed). This model was found to be predictive of toxicity to Vibrio fischeri. The L. gibba quantitative structure-activity relationship showed that a photosensitization factor and a photomodification factor could be combined to describe photoinduced toxicity. To further examine this model, we assessed whether it could be applied to Daphnia magna (water flea), a key bioindicator species in aquatic ecosystems. Toxicity was assessed as median effective concentration and median effective time for immobility. As with L. gibba and V. fischeri, neither the photosensitization factor nor the photomodification factor alone correlated to toxicity in D. magna. However, a photosensitization factor modified for D. magna exhibited a correlation to toxicity (r2 = 0.86), which was modestly improved when summed with a modified photomodification factor (r2 = 0.92). The greatest correlation was observed with median effective concentration data. This research provides evidence that models incorporating factors for photosensitization and photomodification have interspecies applicability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,480
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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