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Enregistrement W2119057480 · doi:10.1093/toxsci/kfn034

Deletion of Yeast CWP Genes Enhances Cell Permeability to Genotoxic Agents

2008· article· en· W2119057480 sur OpenAlexafffund
Min Zhang, Yu-Ping Liang, Xiaohua Zhang, Ying Xu, Heping Dai, Wei Xiao

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational High-tech Research and Development ProgramChinese Academy of SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésYeastCellSaccharomyces cerevisiaeGeneBiologyAmes testReporter geneCell membraneDNAMembrane permeabilityBiochemistryAntimutagenCell biologyMolecular biologyChemistryGeneticsMembraneMutagenGene expressionBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously reported the development of a novel genotoxic testing system based on the transcriptional response of the yeast RNR3-lacZ reporter gene to DNA damage. This system appears to be more sensitive than other similar tests in microorganisms, and is comparable with the Ames test. In an effort to further enhance detection sensitivity, we examined the effects of altering major cell wall components on cell permeability and subsequent RNR3-lacZ sensitivity to genotoxic agents. Although inactivation of single CWP genes encoding cell wall mannoproteins had little effect, the simultaneous inactivation of both CWP1 and CWP2 had profound effects on the cell wall structure and permeability. Consequently, the RNR3-lacZ detection sensitivity is markedly enhanced, especially to high molecular weight compounds such as 4-nitroquinoline-N-oxide (> sevenfold) and phleomycin (> 13-fold). In contrast, deletion of genes encoding representative membrane components or membrane transporters had minor effects on cell permeability. We conclude that the yeast cell wall mannoproteins constitute the major barrier to environmental genotoxic agents and that their removal will significantly enhance the sensitivity of RNR-lacZ as well as other yeast-based genotoxic tests.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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