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Enregistrement W2119133512 · doi:10.1104/pp.105.066647

In Vivo Regulatory Phosphorylation of Novel Phospho<i>enol</i>pyruvate Carboxylase Isoforms in Endosperm of Developing Castor Oil Seeds

2005· article· en· W2119133512 sur OpenAlexaff
Karina E. J. Trípodi, William L. Turner, Sam Gennidakis, William C. Plaxton

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesUniversity of Nebraska-Lincoln
Mots-clésPhosphorylationPhosphoenolpyruvate carboxylaseBiochemistryHomotetramerBiologySerinePyruvate carboxylaseProtein phosphorylationEndospermAspartic acidCarboxy-lyasesCrassulacean acid metabolismGene isoformMolecular biologyProtein subunitEnzymeAmino acidProtein kinase APhotosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our previous research characterized two phosphoenolpyruvate (PEP) carboxylase (PEPC) isoforms (PEPC1 and PEPC2) from developing castor oil seeds (COS). The association of a shared 107-kD subunit (p107) with an immunologically unrelated bacterial PEPC-type 64-kD polypeptide (p64) leads to marked physical and kinetic differences between the PEPC1 p107 homotetramer and PEPC2 p107/p64 heterooctamer. Here, we describe the production of antiphosphorylation site-specific antibodies to the conserved p107 N-terminal serine-6 phosphorylation site. Immunoblotting established that the serine-6 of p107 is phosphorylated in COS PEPC1 and PEPC2. This phosphorylation was reversed in vitro following incubation of clarified COS extracts or purified PEPC1 or PEPC2 with mammalian protein phosphatase type 2A and is not involved in a potential PEPC1 and PEPC2 interconversion. Similar to other plant PEPCs examined to date, p107 phosphorylation increased PEPC1 activity at pH 7.3 by decreasing its K(m)(PEP) and sensitivity to L-malate inhibition, while enhancing glucose-6-P activation. By contrast, p107 phosphorylation increased PEPC2's K(m)(PEP) and sensitivity to malate, glutamic acid, and aspartic acid inhibition. Phosphorylation of p107 was promoted during COS development (coincident with a >5-fold increase in the I(50) [malate] value for total PEPC activity in desalted extracts) but disappeared during COS desiccation. The p107 of stage VII COS became fully dephosphorylated in planta 48 h following excision of COS pods or following 72 h of dark treatment of intact plants. The in vivo phosphorylation status of p107 appears to be modulated by photosynthate recently translocated from source leaves into developing COS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,659

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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