MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2119156186 · doi:10.3324/haematol.2014.109306

Erythrocytosis associated with a novel missense mutation in the BPGM gene

2014· letter· en· W2119156186 sur OpenAlexfundno aff
Nayia Petousi, Richard R. Copley, Terence R.J. Lappin, S.E. Haggan, Celeste Bento, Holger Cario, Melanie J. Percy, Peter J. Ratcliffe, Peter A. Robbins, M. F. McMullin, Peter Donnelly, John I. Bell, D. R. Bentley, Gil McVean, Jenny C. Taylor, Andrew O.M. Wilkie, P. Donelly, John Broxholme, David Buck, Jean‐Baptiste Cazier, Richard J. Cornall, Lynn Gregory, Julian C. Knight, Gerton Lunter, Ian Tomlinson, Christopher Allan, Moustafa Attar, Andrew Green, Sean Humphray, Zoya Kingsbury, Sarah Lamble, Lorne Lonie, Alistair T. Pagnamenta, Paolo Piazza, Guadelupe Polanco, Amy Trebes, Simon Fiddy, Russell Grocock, Edouard Hatton, Chris Holmes, L. Hughes, Peter Humburg, Alexander Kanapin, Stefano Lise, Hilary C. Martin, Lisa Murray, Davis J. McCarthy, Andy Rimmer, Natasha Sahgal, Bruce Wright, Christopher Yau

Notice bibliographique

RevueHaematologica · 2014
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilCentre National de la Recherche ScientifiqueQueen's UniversityNIHR Oxford Biomedical Research CentreUniversity of OxfordImperial College LondonWellcome TrustBritish Heart FoundationAcademy of Medical SciencesNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésMissense mutationMutationGene isoformGeneBiologyTranscription factorMutantHydroxylationHypoxia-inducible factorsGeneticsMolecular biologyBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ERYTHROPOIETIN (EPO) gene is regulated by the transcription factor Hypoxia Inducible Factor-alpha (HIF-alpha). In this pathway, Prolyl Hydroxylase Domain protein 2 (PHD2) hydroxylates two prolyl residues in HIF-alpha, which in turn promotes HIF-alpha degradation by the von Hippel Lindau (VHL) protein. Evidence that HIF-2alpha is the important isoform for EPO regulation in humans comes from the recent observation that mutations in the HIF2A gene are associated with cases of erythrocytosis. We report here a new erythrocytosis-associated mutation, p.Asp539Glu, in the HIF2A gene. Similar to all reported cases, the affected residue is in close vicinity and C-terminal to the primary hydroxylation site in HIF-2alpha, Pro531. This mutation, however, is notable in producing a rather subtle amino acid substitution. Nonetheless, we find that this mutation compromises binding of HIF-2alpha to both PHD2 and VHL, and we propose that this mutation is the cause of erythrocytosis in this individual.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,343
Score d'incertitude au seuil0,897

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHaematologicaMême sujetCancer, Hypoxia, and MetabolismTravaux en français237 207