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Enregistrement W2119165101 · doi:10.1093/gbe/evr075

On Characterizing Adaptive Events Unique to Modern Humans

2011· article· en· W2119165101 sur OpenAlexaff
Jessica L. Crisci, Alex Wong, Jeffrey M. Good, Jeffrey D. Jensen

Notice bibliographique

RevueGenome Biology and Evolution · 2011
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiquePrimate Behavior and Ecology
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésNeanderthalBiologyEvolutionary biologyGenomeConvergent evolutionHuman evolutionExtant taxonNatural selectionSelection (genetic algorithm)PopulationHominidaeHuman evolutionary geneticsHuman genomeAdaptation (eye)PhylogeneticsGeneGeneticsBiological evolutionGeographyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ever since the first draft of the human genome was completed in 2001, there has been increased interest in identifying genetic changes that are uniquely human, which could account for our distinct morphological and cognitive capabilities with respect to other apes. Recently, draft sequences of two extinct hominin genomes, a Neanderthal and Denisovan, have been released. These two genomes provide a much greater resolution to identify human-specific genetic differences than the chimpanzee, our closest extant relative. The Neanderthal genome paper presented a list of regions putatively targeted by positive selection around the time of the human-Neanderthal split. We here seek to characterize the evolutionary history of these candidate regions-examining evidence for selective sweeps in modern human populations as well as for accelerated adaptive evolution across apes. Results indicate that 3 of the top 20 candidate regions show evidence of selection in at least one modern human population (P < 5 × 10(5)). Additionally, four genes within the top 20 regions show accelerated amino acid substitutions across multiple apes (P < 0.01), suggesting importance across deeper evolutionary time. These results highlight the importance of evaluating evolutionary processes across both recent and ancient evolutionary timescales and intriguingly suggest a list of candidate genes that may have been uniquely important around the time of the human-Neanderthal split.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,501
Score d'incertitude au seuil0,867

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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