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Enregistrement W2119258755 · doi:10.1038/ng.2524

A heterozygous moth genome provides insights into herbivory and detoxification

2013· article· en· W2119258755 sur OpenAlexaff
Minsheng You, Zhen Yue, Weiyi He, Xinhua Yang, Guang Yang, Miao Xie, Dongliang Zhan, Simon W. Baxter, Liette Vasseur, Carl J. Douglas, Jianlin Bai, Ping Wang, Kai Cui, Shiguo Huang, Xianchun Li, Qing Zhou, Zhangyan Wu, Qilin Chen, Chunhui Liu, Bo Wang, Xiaojing Li, Xiufeng Xu, Changxin Lu, Min Hu, John W. Davey, Sandy M. Smith, Ming‐Shun Chen, Xiaofeng Xia, Weiqi Tang, Fushi Ke, Dandan Zheng, Yulan Hu, Fengqin Song, Yanchun You, Xiaoli Ma, Peng Lü, Yunkai Zheng, Yong Liang, Yaqiong Chen, Liying Yu, Younan Zhang, Yuanyuan Liu, Guo‐Qing Li, Lin Fang, Jingxiang Li, Xin Zhou, Yadan Luo, Caiyun Gou, Junyi Wang, Jian Wang, Huanming Yang, Jun Wang

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of British ColumbiaBrock University
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Natural Science Foundation of ChinaFujian Agriculture and Forestry UniversityAarhus Universitet
Mots-clésBiologyDiamondback mothHerbivorePlutellaAdaptation (eye)InsectEvolutionary biologyGenomeDetoxification (alternative medicine)GeneGeneticsEcologyLepidoptera genitalia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Minsheng You and colleagues report the whole-genome sequence of the diamondback moth, Plutella xylostella. Their transcriptome analysis from different life stages, together with comparative genomic and phylogenetic analysis, provides insights into herbivore evolution and insect adaptation to plant feeding and detoxification. How an insect evolves to become a successful herbivore is of profound biological and practical importance. Herbivores are often adapted to feed on a specific group of evolutionarily and biochemically related host plants1, but the genetic and molecular bases for adaptation to plant defense compounds remain poorly understood2. We report the first whole-genome sequence of a basal lepidopteran species, Plutella xylostella, which contains 18,071 protein-coding and 1,412 unique genes with an expansion of gene families associated with perception and the detoxification of plant defense compounds. A recent expansion of retrotransposons near detoxification-related genes and a wider system used in the metabolism of plant defense compounds are shown to also be involved in the development of insecticide resistance. This work shows the genetic and molecular bases for the evolutionary success of this worldwide herbivore and offers wider insights into insect adaptation to plant feeding, as well as opening avenues for more sustainable pest management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations578
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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