MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2119289212 · doi:10.1017/s0031182007002995

Patterns of gene expression in schistosomes: localization by whole mount<i>in situ</i>hybridization

2007· article· en· W2119289212 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueParasitology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasites and Host Interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesYork UniversityWellcome Trust
Mots-clésBiologyViral tegumentIn situ hybridizationGene expressionGeneMolecular biologyCell biologyGene expression profilingGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As a consequence of comprehensive transcriptome analysis followed by sequencing and draft assembly of the genome, the emphasis of schistosome research is shifting from the identification of genes to the characterization of their functions and interactions. Developmental biologists have long used whole mount in situ hybridization (WISH) to determine gene expression patterns, as a vital tool for formulating and testing hypotheses about function. This paper describes the application of WISH to the study of gene expression in larval and adult schistosomes. Fixed worms were permeablized by proteinase K treatment for hybridization with digoxygenin-labelled RNA probes, with binding being detected by alkaline phosphatase-coupled anti-digoxygenin antibodies, and BM Purple substrate. Discrete staining patterns for the transcripts of the molecules Sm29, cathepsin L, antigen 10.3 and chorion were observed in the tegument cell bodies, gut epithelium, oesophageal gland and vitelline lobules, respectively, of adult worms. Transcripts of the molecules SGTP4, GP18-22 and cathepsin L were localized to tegument cell bodies and embryonic gut, respectively, of lung schistosomula. We also showed that Fast Red TR fluorescent substrate can refine the pattern of localization permitting use of confocal microscopy. We believe that method of WISH will find broad application, in synergy with other emerging post-genomic techniques, such as RNA interference, to studies focused at increasing our molecular understanding of schistosomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil0,535

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle