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Enregistrement W2119301589 · doi:10.1186/1479-5876-10-205

Cancer classification using the Immunoscore: a worldwide task force

2012· review· en· W2119301589 sur OpenAlexaff
Jérôme Galon, Franck Pagès, Francesco M. Marincola, Helen K. Angell, Alessandro Lugli, Inti Zlobec, Anne Berger, Carlo Bifulco, Gerardo Botti, Fabiana Tatangelo, Cedrik M. Britten, Sebastian Kreiter, Lotfi Chouchane, Paolo Delrio, Martin Asslaber, Michele Maio, Giuseppe Masucci, Martin Mihm, Fernando Vidal‐Vanaclocha, James P. Allison, Sacha Gnjatic, Leif Håkansson, Christoph Huber, Harpreet Singh‐Jasuja, Christian H. Ottensmeier, H. Zwierzina, Luigi Laghi, Fabio Grizzi, Pamela S. Ohashi, Patricia A. Shaw, Blaise Clarke, Bradly G. Wouters, Yutaka Kawakami, Shoichi Hazama, Kiyotaka Okuno, Ena Wang, Jill O’Donnell-Tormey, Christine Lagorce, Graham Pawelec, Michael I. Nishimura, Robert D. Hawkins, Réjean Lapointe, Andreas Lundqvist, Samir N. Khleif, Shuji Ogino, Peter Gibbs, Paul Waring, Noriyuki Sato, Toshihiko Torigoe, Kyogo Itoh, Prabhudas S. Patel, Shilin N. Shukla, Richard Palmqvist, Irıs D. Nagtegaal, Yili Wang, Corrado D’Arrigo, Scott Kopetz, Frank A. Sinicrope, Giorgio Trinchieri, Thomas F. Gajewski, Paolo A. Ascierto, Bernard A. Fox

Notice bibliographique

RevueJournal of Translational Medicine · 2012
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensUniversité de MontréalPrincess Margaret Cancer CentreInstitute for Research in Immunology and CancerUniversity Health NetworkOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteInstitut National Du CancerJapan Association for Chemical InnovationSociety for Immunotherapy of CancerCancer Research Institute
Mots-clésMedicineOncologyCancerBiomarkerImmune systemInternal medicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prediction of clinical outcome in cancer is usually achieved by histopathological evaluation of tissue samples obtained during surgical resection of the primary tumor. Traditional tumor staging (AJCC/UICC-TNM classification) summarizes data on tumor burden (T), presence of cancer cells in draining and regional lymph nodes (N) and evidence for metastases (M). However, it is now recognized that clinical outcome can significantly vary among patients within the same stage. The current classification provides limited prognostic information, and does not predict response to therapy. Recent literature has alluded to the importance of the host immune system in controlling tumor progression. Thus, evidence supports the notion to include immunological biomarkers, implemented as a tool for the prediction of prognosis and response to therapy. Accumulating data, collected from large cohorts of human cancers, has demonstrated the impact of immune-classification, which has a prognostic value that may add to the significance of the AJCC/UICC TNM-classification. It is therefore imperative to begin to incorporate the 'Immunoscore' into traditional classification, thus providing an essential prognostic and potentially predictive tool. Introduction of this parameter as a biomarker to classify cancers, as part of routine diagnostic and prognostic assessment of tumors, will facilitate clinical decision-making including rational stratification of patient treatment. Equally, the inherent complexity of quantitative immunohistochemistry, in conjunction with protocol variation across laboratories, analysis of different immune cell types, inconsistent region selection criteria, and variable ways to quantify immune infiltration, all underline the urgent requirement to reach assay harmonization. In an effort to promote the Immunoscore in routine clinical settings, an international task force was initiated. This review represents a follow-up of the announcement of this initiative, and of the J Transl Med. editorial from January 2012. Immunophenotyping of tumors may provide crucial novel prognostic information. The results of this international validation may result in the implementation of the Immunoscore as a new component for the classification of cancer, designated TNM-I (TNM-Immune).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,039
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,209

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0390,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0100,010
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0050,006
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,153
Tête enseignante GPT0,413
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations803
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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