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Enregistrement W2119356394 · doi:10.1039/c3an36771a

Multifunctional electrochemical aptasensor for aptamer clones screening, virus quantitation in blood and viability assessment

2013· article· en· W2119356394 sur OpenAlexafffund
Mahmoud Labib, Anna S. Zamay, Maxim V. Berezovski

Notice bibliographique

RevueThe Analyst · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAptamerVirusChemistryVirologyDetection limitMolecular biologyChromatographyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A novel attempt was made to develop a disposable multifunctional sensor for analysis of vaccinia virus (VACV), a promising oncolytic agent that can replicate in and kill tumor cells. Briefly, we developed aptamers specific to VACV that were negatively selected against human serum as well as human and mouse blood to be further utilized for viral analysis directly in serum and blood. In addition, the aptamers were negatively selected against heat-inactivated VACV to enable them to distinguish between viable and nonviable virus particles. The selected aptamers were integrated onto an electrochemical aptasensor to perform multiple functions, including quantification of VACV, viability assessment of the virus, and estimation of the binding affinity between the virus and the developed aptamers. The aptasensor was fabricated by self-assembling a hybrid of a thiolated ssDNA primer and a VACV-specific aptamer onto a gold nanoparticles modified screen-printed carbon electrode (GNPs-SPCE). Square wave voltammetry was employed to quantify VACV in serum and blood within the range of 150-900 PFU, with a detection limit of 60 PFU in 30 μL. According to the electrochemical affinity measurements, three virus specific aptamer clones, V-2, V-5, and V-9 exhibited the highest affinity to VACV. Furthermore, flow cytometry was employed to estimate the dissociation constants of the clones which were found to be 26.3, 40.9, and 24.7 nM, respectively. Finally, the developed aptasensor was able to distinguish between the intact virus and the heat-inactivated virus thanks to the tailored selectivity of the aptamers that was achieved via negative selection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,307

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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