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Enregistrement W2119558650 · doi:10.4172/2168-9547.1000103

Regulation of Myf5 Early Enhancer by Histone Acetyltransferase P300 during Stem Cell Differentiation

2012· article· en· W2119558650 sur OpenAlexafffund
Tanja Francetic, Melanie Le May

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMYF5EnhancerHistone acetyltransferaseBiologyMyogenesisPCAFCell biologyHistoneAcetylationInduced pluripotent stem cellCellular differentiationHistone H3Transcription factorEmbryonic stem cellMyoDGeneticsGeneMyocyte

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Skeletal myogenesis is an intricate process coordinated temporally by multiple myogenic regulatory factors (MRF) including Myf5, which is the first MRF expressed and marks the commitment of skeletal muscle lineage.The expression of Myf5 gene during early embryogenesis is controlled by a set of enhancer elements, and requires the histone acetyltransferase (HAT) activity of transcriptional coactivator p300.However, it is unclear as to how different regulatory signals converge at enhancer elements to regulate early Myf5 gene expression, and if p300 is directly involved.We show here that p300 associates with the Myf5 early enhancer at the early stage of stem cell differentiation, and its HAT activity is important for the recruitment of β-catenin to this early enhancer.In addition, histone H3-K27 acetylation, but not H3-K9/14, is intimately connected to the p300 HAT activity.Thus, p300 is directly involved in the regulation of the Myf5 early enhancer, and is important for specific histone acetylation and transcription factor recruitment.This connection of p300 HAT activity with H3-K27 acetylation and β-catenin signalling during myogenic differentiation in vitro offers a molecular insight into the enhancer-elements participation observed in embryonic development.In addition, pluripotent stem cell differentiation is a valuable system to dissect the signal-dependent regulation of specific enhancer element during cell fate determinations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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