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Enregistrement W2119592530 · doi:10.3852/13-367

Genomewide mutation dynamic within a long-lived individual of <i>Armillaria gallica</i>

2014· article· en· W2119592530 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMycologia · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensUniversity of TorontoGeneral Electric (Canada)
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyGeneticsContext (archaeology)ArmillariaPloidyPhylogenetic treeLoss of heterozygosityEvolutionary biologySanger sequencingMutationGenotypeBotanyAlleleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutation is the ultimate source of all genetic variation in populations and yet they remain unobservable and buried in the past. Long-lived individuals of Armillaria gallica, a common opportunistic fungal pathogen of tree roots in temperate forests of the northern hemisphere, provide a spatial context for examining the mutational dynamic. Each individual of A. gallica arises in a single mating between two haploid gametes and the resulting diploid then grows vegetatively to occupy a discrete spatial territory often including many adjacent tree root systems. In effect, this leaves a spatial record of growth over time within which mutations can be localized. To identify mutations, the entire genomes of three spatially separated samples of one individual of A. gallica approximately 200 × 60 m were sequenced and compared. In this comparison, mutations and regions of loss of heterozygosity (LOH) were identified then assayed in another 20 isolates from the same individual by conventional PCR and Sanger sequencing. The genotype network of all mutations and LOH were without internal conflict. Further, the spatial pattern of genotypes was nonrandom and appeared to reflect the vegetative expansion leading to the present-day individual. The results reflect the spectrum of spontaneous mutation in nature and provide insight into cellular generation times.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,831
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle