Genomewide mutation dynamic within a long-lived individual of <i>Armillaria gallica</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Mutation is the ultimate source of all genetic variation in populations and yet they remain unobservable and buried in the past. Long-lived individuals of Armillaria gallica, a common opportunistic fungal pathogen of tree roots in temperate forests of the northern hemisphere, provide a spatial context for examining the mutational dynamic. Each individual of A. gallica arises in a single mating between two haploid gametes and the resulting diploid then grows vegetatively to occupy a discrete spatial territory often including many adjacent tree root systems. In effect, this leaves a spatial record of growth over time within which mutations can be localized. To identify mutations, the entire genomes of three spatially separated samples of one individual of A. gallica approximately 200 × 60 m were sequenced and compared. In this comparison, mutations and regions of loss of heterozygosity (LOH) were identified then assayed in another 20 isolates from the same individual by conventional PCR and Sanger sequencing. The genotype network of all mutations and LOH were without internal conflict. Further, the spatial pattern of genotypes was nonrandom and appeared to reflect the vegetative expansion leading to the present-day individual. The results reflect the spectrum of spontaneous mutation in nature and provide insight into cellular generation times.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle