A regulatory cascade of three homeobox genes,<i>ceh-10</i>,<i>ttx-3</i>and<i>ceh-23</i>, controls cell fate specification of a defined interneuron class in<i>C. elegans</i>
Notice bibliographique
Résumé
The development of the nervous system requires the coordinated activity of a variety of regulatory factors that define the individual properties of specific neuronal subtypes. We report a regulatory cascade composed of three homeodomain proteins that act to define the properties of a specific interneuron class in the nematode C. elegans. We describe a set of differentiation markers characteristic for the AIY interneuron class and show that the ceh-10 paired-type and ttx-3 LIM-type homeobox genes function to regulate all known subtype-specific features of the AIY interneurons. In contrast, the acquisition of several pan-neuronal features is unaffected in ceh-10 and ttx-3 mutants, suggesting that the activity of these homeobox genes separates pan-neuronal from subtype-specific differentiation programs. The LIM homeobox gene ttx-3 appears to play a central role in regulation of AIY differentiation. Not only are all AIY subtype characteristics lost in ttx-3 mutants, but ectopic misexpression of ttx-3 is also sufficient to induce AIY-like features in a restricted set of neurons. One of the targets of ceh-10 and ttx-3 is a novel type of homeobox gene, ceh-23. We show that ceh-23 is not required for the initial adoption of AIY differentiation characteristics, but instead is required to maintain the expression of one defined AIY differentiation feature. Finally, we demonstrate that the regulatory relationship between ceh-10, ttx-3 and ceh-23 is only partially conserved in other neurons in the nervous system. Our findings illustrate the complexity of transcriptional regulation in the nervous system and provide an example for the intricate interdependence of transcription factor action.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».