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Enregistrement W2119749825 · doi:10.1091/mbc.e04-02-0144

Transcription Profiling of Cyclic AMP Signaling in<i>Candida albicans</i>

2004· article· en· W2119749825 sur OpenAlexafffund
Doreen Harcus, André Nantel, Anne Marcil, Tracey Rigby, Malcolm Whiteway

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensMcGill UniversityBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGenomic Health
Mots-clésBiologyAdenylyl cyclasecAMP-dependent pathwayADCY9Candida albicansGeneCell biologyTranscription factorEffectorRegulation of gene expressionGeneticsSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We used transcription profiling in Candida albicans to investigate cellular regulation involving cAMP. We found that many genes require the adenylyl cyclase Cdc35p for proper expression. These include genes encoding ribosomal subunit proteins and RNA polymerase subunit proteins, suggesting that growth could be controlled in part by cAMP-mediated modulation of gene expression. Other genes influenced by loss of adenylyl cyclase are involved in metabolism, the cell wall, and stress response and include a group of genes of unknown function that are unique to C. albicans. The profiles generated by loss of the adenylyl cyclase regulator Ras1p and a downstream effector Efg1p were also examined. The loss of Ras1p function disturbs the expression of a subset of the genes regulated by adenylyl cyclase, suggesting both that the primary role of Ras1p in transcriptional regulation involves its influence on the function of Cdc35p and that there are Ras1p independent roles for Cdc35p. The transcription factor Efg1p is also needed for the expression of many genes; however, these genes are distinct from those modulated by Cdc35p with the exception of a class of hyphal-specific genes. Therefore transcription profiling establishes that cAMP plays a key role in the overall regulation of gene expression in C. albicans, and enhances our detailed understanding of the circuitry controlling this regulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,228

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations152
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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