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Enregistrement W2119762280 · doi:10.1094/pdis-03-13-0320-pdn

First Report of Sphaeropsis Rot of Apple Caused by <i>Sphaeropsis pyriputrescens</i> in New York

2013· article· en· W2119762280 sur OpenAlexaboutno aff
Y. K. Kim, R. Caiazzo, P. Sikdar, C. L. Xiao

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPycnidiumBiologyMalusHorticulturePotato dextrose agarConidiumBotanyMyceliumFungusAgarBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In March 2012, decayed 'Empire' apple fruit (Malus × domestica Borkh.) were sampled from apples grown in Albion (Orleans County) in New York State and stored in bins for 6 months under controlled atmosphere at a commercial packinghouse. At the packinghouse following storage prior to be packed, the fruit were completely rotten, spongy to firm, and light brown without pycnidia. All fruit rots originated from either stem-end or calyx-end infections but no wound infections were observed. The incidence of fruit with these symptoms in the total decay was relatively low (0.1%). To isolate the causal agent, small fragments of fruit flesh from 12 decayed fruit were cut and placed on potato dextrose agar (PDA) acidified with 0.1% lactic acid. The plates were incubated at 20°C for 4 days and sub-cultured on PDA to obtain a pure culture. The colonies initially appeared with dense hyaline mycelium and later turned light yellow to yellow, and black pycnidia formed after about 2 weeks of incubation under a 24-h fluorescent light at 20°C. Conidia were light brown to brown, clavate to subglobose to irregular, and 15 × 8 μm on average. The fungus was identified as Sphaeropsis pyriputrescens Xiao & J.D. Rogers based on the morphology of the fungus (3). The identity of a representative isolate was further confirmed by analysis of nucleotide sequences of the internal transcribed spacer (ITS) regions amplified using the primers ITS1/ITS4. A BLAST search in GenBank showed that the sequence had 99% homology to an S. pyriputrescens sequence (Accession No. GQ374241). One representative isolate was tested for pathogenicity on apple fruit. Organic 'Red Delicious' apple fruit were surface-disinfected in 0.6% sodium hypochlorite solution for 5 min, rinsed twice with deionized water, and air-dried. Each fruit was wounded with a sterilized finish-nail head (3 mm in depth and 4 mm in diameter) and inoculated by placing a 4-mm-diameter plug from the leading edge of a 4-day-old PDA culture on the wound. Control fruit were treated with sterile PDA plugs. The inoculation site was covered with two layers of moist cheesecloth to avoid dehydration. There were four 10-fruit replicates for each treatment, and fruit were placed in plastic crispers and stored at 4°C for 4 weeks. The experiments were conducted twice. Sphaeropsis rot developed on all inoculated fruit, while no decays appeared on the control fruit. Koch's postulates were fulfilled by reisolating the fungus from the decayed fruit. Sphaeropsis rot is a recently reported postharvest fruit rot disease of apple and pear (1,3). The disease was first observed on 'd'Anjou' pears, and later more serious economic losses were observed in apples in Washington State (1). The disease has also since been reported in British Columbia, Canada (2). To the best of our knowledge, this is the first report of the occurrence of Sphaeropsis rot caused by S. pyriputrescens on apple in New York or in any region outside of the Pacific Northwest in North America. References: (1) Y. K. Kim and C. L. Xiao. Plant Dis. 92:940, 2008. (2) P. L. Sholberg et al. Plant Dis. 93:843, 2009. (3) C. L. Xiao et al. Plant Dis. 88:223, 2004.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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