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Enregistrement W2119784506 · doi:10.1645/ge-2853.1

Detection of Cryptosporidium sp. in Two New Seal Species, Phoca vitulina and Cystophora cristata, and a Novel Cryptosporidium Genotype in a Third Seal Species, Pagophilus groenlandicus, from the Gulf of Maine

2012· article· en· W2119784506 sur OpenAlexaboutno aff
Anna L. Bass, Carden C. Wallace, Philip O. Yund, Tim Ford

Notice bibliographique

RevueJournal of Parasitology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasitic Infections and Diagnostics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of New EnglandElmina B. Sewall Foundation
Mots-clésPhocaBiologyCryptosporidiumZoologyEcologyFeces

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Data on the geographic distribution and host specificity of Cryptosporidium spp. are critical for developing an understanding of likely transmission patterns in nature. During a molecular-based survey of fecal samples from 293 terrestrial and aquatic animals in Maine, USA, we detected Cryptosporidium sp. in 11 harbor seals (Phoca vitulina), 1 hooded seal (Cystophora cristata), and 1 harp seal (Pagophilus groenlandicus). None of the terrestrial or freshwater mammal fecal samples or bird samples tested positive for Cryptosporidium sp. However, the sequencing results of the small subunit (ssu) rRNA gene indicate that the seals were infected with an undescribed species of Cryptosporidium , previously isolated only from ringed seals (Phoca hispida) in northern Quebec, Canada. In addition, the Cryptosporidium sp. detected in the harp seal is significantly different from the previously observed Cryptosporidium sp. in other seals. We confirmed the genetic distinctiveness of this Cryptosporidium genotype and the identity of the other Cryptosporidium sp. seal ssu rRNA sequences by using data from the 70-kDa heat shock protein gene. Based on phylogenetic reconstructions of both genes, it seems that either Cryptosporidium canis or C. felis are sister species to the seal associated Cryptosporidium spp. Our findings extend the range of " Cryptosporidium sp. seal" well south of the 55th parallel, add other species to the list of seals affected by Cryptosporidium sp., and highlight the presence of unrecognized population and potentially species level variation in Cryptosporidium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,234
Score d'incertitude au seuil0,708

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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