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Enregistrement W2119788441 · doi:10.1093/jhered/ess003

Maternal Lineages in Native Canadian Equine Populations and Their Relationship to the Nordic and Mountain and Moorland Pony Breeds

2012· article· en· W2119788441 sur OpenAlexafffundabout
Jaclyn Mercedes Prystupa, Pamela Hind, E. Gus Cothran, Y. Plante

Notice bibliographique

RevueJournal of Heredity · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésBiologyNucleotide diversityGenetic diversityPopulationBreedZoologyHaplotypeCladeEcologyPhylogenetic treeGeneticsDemographyAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A 378-bp section of the mitochondrial displacement loop was used to estimate genetic diversity in the native Canadian equine populations. The inclusion of 10 Mountain and Moorland, 3 Nordic pony breeds, 2 feral populations, and 5 horse breeds were also investigated as they may have influenced the development (or rejuvenation) of the native Canadian populations. A total of 281 samples were sequenced, which produced 75 haplotypes derived from 54 informative sites. On further investigation, 36 of these 75 haplotypes were found to be previously unreported. Overall, total diversity was lowest in the feral Sable Island population with a haplotype diversity (0.27 ± 0.12), nucleotide diversity (0.0007 ± 0.0004), and pairwise difference of 0.286 ± 0.317. This is not surprising due to the geographic isolation of this population. Haplotype diversity was highest (1.00 ± 0.13) in the New Forest population, pairwise difference was highest (8.061 ± 4.028) in the Icelandic breed, whereas nucleotide diversity was highest in the Exmoor breed (0.0209 ± 0.0025). Within the Canadian populations, haplotype diversity was highest in the Newfoundland pony (0.96 ± 0.08), whereas pairwise difference and nucleotide diversity was highest in the Canadian horse (7.090 ± 3.581 and 0.0188 ± 0.0042, respectively). Three different estimates of genetic distances were used to examine the phylogenetic relationships amongst these populations. All 3 estimates produced similar topologies. In general, the native Canadian populations were highly represented in the D clade, with particular emphasis in the D1 and D2 clades. This is an important factor when considering the phylogenetic conservation of these Canadian equine populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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