<scp>H</scp>fq binds directly to the ribosome‐binding site of <scp>IS</scp><i>10</i> transposase m<scp>RNA</scp> to inhibit translation
Notice bibliographique
Résumé
Hfq is a critical component of post-transcriptional regulatory networks in most bacteria. It usually functions as a chaperone for base-pairing small RNAs, although non-canonical regulatory roles are continually emerging. We have previously shown that Hfq represses IS10/Tn10 transposase expression through both antisense RNA-dependent and independent mechanisms. In the current work, we set out to define the regulatory role of Hfq in the absence of the IS10 antisense RNA. We show here that an interaction between the distal surface of Hfq and the ribosome-binding site of transposase mRNA (RNA-IN) is required for repressing translation initiation. Additionally, this interaction was critical for the in vivo association of Hfq and RNA-IN. Finally, we present evidence that the small RNA ChiX activates transposase expression by titrating Hfq away from RNA-IN. The current results are considered in the broader context of Hfq biology and implications for Hfq titration by ChiX are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».