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Enregistrement W2119819241 · doi:10.1111/mmi.12961

<scp>H</scp>fq binds directly to the ribosome‐binding site of <scp>IS</scp><i>10</i> transposase m<scp>RNA</scp> to inhibit translation

2015· article· en· W2119819241 sur OpenAlex
Michael J. Ellis, Ryan S. Trussler, David B. Haniford

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyTransposaseRibosomal binding siteTranslation (biology)RibosomeRNA-binding proteinRNACell biologyBinding siteMessenger RNAMolecular biologyBiochemistryGeneTransposable element

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hfq is a critical component of post-transcriptional regulatory networks in most bacteria. It usually functions as a chaperone for base-pairing small RNAs, although non-canonical regulatory roles are continually emerging. We have previously shown that Hfq represses IS10/Tn10 transposase expression through both antisense RNA-dependent and independent mechanisms. In the current work, we set out to define the regulatory role of Hfq in the absence of the IS10 antisense RNA. We show here that an interaction between the distal surface of Hfq and the ribosome-binding site of transposase mRNA (RNA-IN) is required for repressing translation initiation. Additionally, this interaction was critical for the in vivo association of Hfq and RNA-IN. Finally, we present evidence that the small RNA ChiX activates transposase expression by titrating Hfq away from RNA-IN. The current results are considered in the broader context of Hfq biology and implications for Hfq titration by ChiX are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,340
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle