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Enregistrement W2119854747 · doi:10.1073/pnas.0402085101

Trans-bonded pairs of E-cadherin exhibit a remarkable hierarchy of mechanical strengths

2004· article· en· W2119854747 sur OpenAlexaff
Emilie Perret, A. Leung, Hélène Feracci, E. Evans

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCentre National de la Recherche ScientifiqueAssociation pour la Recherche sur le Cancer
Mots-clésCadherinAdhesionBiophysicsCytoskeletonCell adhesionForce spectroscopyChemistryCell biologyBiologyMaterials scienceCellNanotechnologyBiochemistryAtomic force microscopy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Classical cadherins are primary mediators of calcium-dependent cell interactions in multicellular organisms. Organized in five tandemly repeated E-cadherin (EC) modules, the extracellular segments of these membrane-spanning glycoproteins interact homophilically between opposing cells to create highly regulated patterns of attachment stabilized by cytoskeletal elements inside the cells. Despite many structural and functional studies, a significant controversy exists in regard to the organization of cadherin binding in adhesion sites. Supported by considerable evidence, perhaps the most widely held view is that opposing N-terminal EC1-EC2 (EC12) domains form a "zipper" of bonds. However, immobilized on two atomically smooth surfaces and pushed to adhesive contact, opposing cadherins become fully interdigitated and unbind through three discrete jumps comparable with domain dimensions when pulled apart. So the question remains as to whether mechanical adhesion strength emanates solely from interactions between the peripheral N-terminal domains or involves multiple overlapping domains. It is also unclear whether a primary adhesion complex is formed by a single opposing pair of cadherins or whether the complex involves a more complicated network of cis-bonded multimers. To address these questions, we used a special jump/ramp mode of force spectroscopy to test isolated pairwise interactions between recombinant fragments of ECs. Besides the formation of strong trans-bonded dimers, we find a remarkable hierarchy of rupture strengths for bonds between the full five-domain fragments that suggests multiple mechanical functions for cadherins, perhaps providing distinct properties needed for transient-specific recognition as well as stable tissue formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,222

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations138
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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