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Enregistrement W2119854752 · doi:10.1111/mmi.12892

Structural basis for targeting the ribosomal protein <scp>S</scp>1 of <scp><i>M</i></scp><i>ycobacterium tuberculosis</i> by pyrazinamide

2014· article· en· W2119854752 sur OpenAlexafffund
Juanjuan Yang, Yindi Liu, Jing Bi, Qixu Cai, Xinli Liao, Wenqian Li, Chenyun Guo, Qian Zhang, Tianwei Lin, Yufen Zhao, Honghai Wang, Jun Liu, Xuelian Zhang, Donghai Lin

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyPyrazinamideTuberculosisRibosomal proteinRibosomal RNARibosomeComputational biologyMycobacterium tuberculosisVirologyMicrobiologyGeneticsAntibioticsRifampicinRNAPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pyrazinamide (PZA) is a first-line drug for tuberculosis (TB) treatment and is responsible for shortening the duration of TB therapy. The mode of action of PZA remains elusive. RpsA, the ribosomal protein S1 of Mycobacterium tuberculosis (Mtb), was recently identified as a target of PZA based on its binding activity to pyrazinoic acid (POA), the active form of PZA. POA binding to RpsA led to the inhibition of trans-translation. However, the nature of the RpsA-POA interaction remains unknown. Key questions include why POA exhibits an exquisite specificity to RpsA of Mtb and how RpsA mutations confer PZA resistance. Here, we report the crystal structures of the C-terminal domain of RpsA of Mtb and its complex with POA, as well as the corresponding domains of two RpsA variants that are associated with PZA resistance. Structural analysis reveals that POA binds to RpsA through hydrogen bonds and hydrophobic interactions, mediated mainly by residues (Lys303, Phe307, Phe310 and Arg357) that are essential for tmRNA binding. Conformational changes induced by mutation or sequence variation at the C-terminus of RpsA abolish the POA binding activity. Our findings provide insights into the mode of action of PZA and molecular basis of PZA resistance associated with RpsA mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,193
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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