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Identification of DNA Regions Specific to the X and Y Chromosomes in Sphaerocarpos texanus

2001· article· en· W2119908347 sur OpenAlexfundno aff
D. Nicholas McLetchie

Notice bibliographique

RevueThe Bryologist · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBryophyte Studies and Records
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of British ColumbiaUniversity of Kentucky
Mots-clésBiologyGeneticsSexual dimorphismPopulationEvolutionary biologySex linkageZoologyGeneChromosomeDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The majority of dioecious plants are not sexually dimorphic until the onset of reproductive maturation. The inability to identify sex in pre-reproductive plants limits sex-related studies in plant populations. Molecular techniques to identify sex in seed plants have had increasing success. However, sex-specific markers in bryophytes have not yet been found. Bryophytes can be effective model systems in understanding the reproductive biology of plant species with unisexual individuals, as well as the molecular biology of sex chromosomes and sex determination. This study was specifically designed to find sex-specific markers in Sphaerocarpos texanus. The study relied on the Polymerase Chain Reaction procedure to amplify arbitrary regions of genomic DNA to locate sex-specific markers. Bulk segregant analysis using 238 decamer primers, and involving a single full-sibling pedigree was used to identify sex-specific markers. Inheritance of specific markers by male or female individuals was tested in progeny derived from two mated pairs involving individuals in the pedigree. Consistency of the markers was tested with individuals outside the original pedigree in the same population as well as with individuals from a distant population. Four markers were found—three specific to females and one specific to males.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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