Cloning and Characterization of the Bile Salt Hydrolase Genes ( <i>bsh</i> ) from <i>Bifidobacterium bifidum</i> Strains
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Notice bibliographique
Résumé
Biochemical characterization of the purified bile salt hydrolase (BSH) from Bifidobacterium bifidum ATCC 11863 revealed some distinct characteristics not observed in other species of Bifidobacterium. The bsh gene was cloned from B. bifidum, and the DNA flanking the bsh gene was sequenced. Comparison of the deduced amino acid sequence of the cloned gene with previously known sequences revealed high homology with BSH enzymes from several microorganisms and penicillin V amidase (PVA) of Bacillus sphaericus. The proposed active sites of PVA were highly conserved, including that of the Cys-1 residue. The importance of the SH group in the N-terminal cysteine was confirmed by substitution of Cys with chemically and structurally similar residues, Ser or Thr, both of which resulted in an inactive enzyme. The transcriptional start point of the bsh gene has been determined by primer extension analysis. Unlike Bifidobacterium longum bsh, B. bifidum bsh was transcribed as a monocistronic unit, which was confirmed by Northern blot analysis. PCR amplification with the type-specific primer set revealed the high level of sequence homology in their bsh genes within the species of B. bifidum.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle