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Enregistrement W2120040420 · doi:10.1186/1743-422x-4-49

Nuclear import of influenza A viral ribonucleoprotein complexes is mediated by two nuclear localization sequences on viral nucleoprotein

2007· article· en· W2120040420 sur OpenAlexafffund
Winco W.H. Wu, Ying-Hua Sun, Nelly Panté

Notice bibliographique

RevueVirology Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRibonucleoproteinNucleoproteinBiologyNuclear transportVirologyNuclear localization sequenceNuclear export signalSmall nuclear ribonucleoproteinInfluenza A virusCell nucleusVirusCell biologyMolecular biologyRNANucleusGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The influenza A virus replicates in the nucleus of its host cell. Thus, entry of the influenza genome into the cell nucleus is necessary for establishing infection. The genome of the influenza A virus consists of eight single-stranded, negative-sense RNA molecules, individually packed with several copies of the viral nucleoprotein (NP) into ribonucleoprotein particles (vRNPs). These vRNPs are large, rod-shaped complexes containing a core of NP, around which the RNA is helically wrapped. The vRNPs are the entities that enter the nucleus, and their nuclear import must be mediated by nuclear localization sequences (NLSs) exposed on the vRNPs. NP contains at least two putative NLSs, one at the N-terminus (NLS1) and one in the middle (NLS2) of the protein. These NP NLSs have been shown to mediate the nuclear import of recombinant NP molecules. However, it remains to be determined which NLS mediates the nuclear import of influenza vRNP complexes. RESULTS: To directly track the nuclear import of the influenza A genome, we developed an experimental assay based on digitonin-permeabilized cells and fluorescently-labeled vRNPs isolated from the influenza A virus. We used this assay to determine the contribution of the two proposed NLSs on NP to the nuclear import of influenza vRNP complexes. Peptides that mimic each of the two NLSs on NP were used to compete with vRNPs for their nuclear import receptors. In addition, antibodies against the two NP NLSs were used to block the NLSs on the vRNP complexes, and thereby inhibit vRNP nuclear import. Both peptide competition and antibody inhibition of either sequence resulted in decreased nuclear accumulation of vRNPs. The two sequences act independently of each other, as inhibition of only one of the two NLSs still resulted in significant, though diminished, nuclear import of vRNPs. Furthermore, when both sequences were blocked, vRNP nuclear import was almost completely inhibited. Antibody inhibition studies further showed that NLS1 on NP is the main contributor to the nuclear import of vRNPs. CONCLUSION: Our results demonstrate that both NLS1 and NLS2 on NP can mediate the nuclear uptake of influenza A vRNPs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations109
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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