Fragile X Mental Retardation protein determinants required for its association with polyribosomal mRNPs
Notice bibliographique
Résumé
Fragile X Mental Retardation protein (FMRP) is an RNA-binding protein that contains multiple domains with apparently differential affinity to mRNA and to the ribonucleotide homopolymer poly(G). Attempts have been made to map the RNA-binding sites along the protein sequence with a view to determining which of the KH1, KH2 and RGG domains are required to recognize and bind to RNA. While these studies have greatly contributed to the delineation of domains that bind homopolymers or mRNA in vitro, little is known concerning their implications in FMRP function(s) in vivo. To address this question, we have prepared a series of FMRP versions, in which each known in vitro functional domain has been individually deleted, leaving the rest of the protein intact. Constructs with deletions in the protein-protein interaction and RNA-binding as well as in the phosphorylation domains were expressed in STEK-KO cells lacking FMRP and their recruitment into polyribosomal mRNPs and their intra-cellular localization were determined. Our results indicate that the KH RNA-binding domains and the Protein-Protein Interacting domain are essential for FMRP to associate with polyribosomal mRNPs, while the RGG box and the phosphorylated domains are dispensable.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».