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Enregistrement W2120067757 · doi:10.1039/c2mt20027a

Cell density-dependent shift in activity of iron regulatory protein 1 (IRP-1)/cytosolic (c-)aconitase

2012· article· en· W2120067757 sur OpenAlexaff
Zvezdana Popović, Douglas M. Templeton

Notice bibliographique

RevueMetallomics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensCanada Research ChairsUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAconitaseCytosolBiochemistryTransferrin receptorCell biologyChemistryOxidative phosphorylationMetabolismTransferrinBiologyMitochondrionEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Iron regulatory protein 1 (IRP-1) is a bifunctional protein involved in iron homeostasis and metabolism. In one state, it binds to specific sequences in the mRNA's of several proteins involved in iron and energy metabolism, thereby influencing their expression post-transcriptionally. In another state it contains a [4Fe-4S] iron-sulfur cofactor and displays aconitase activity in the cytosol. We have shown that this protein binds and hydrolyzes ATP, with kinetic and thermodynamic equilibrium constants that predict saturation with ATP, favouring a non-RNA-binding form at normal cellular ATP levels, and thus pointing to additional function(s) of the protein. Here we show for the first time that the RNA-binding and aconitase forms of IRP-1 can undergo interconversion dependent on the density of cells growing in culture. Thus, in high density confluent cultures, compared with low density, actively proliferating cultures, cytosolic aconitase activity is increased whereas RNA binding activity is diminished. This is accompanied by a decrease in transferrin receptor expression in confluent cells, possibly due to loss of the transcript-stabilizing activity of bound IRP-1. In high density HepG2 cultures, cytosolic glutamate and the ratio of reduced-to-oxidized glutathione were increased. We propose that increased cytosolic aconitase activity in confluent cultures may divert cytosolic citrate away from the fatty acid/membrane synthetic pathways required by dividing cells, into a glutamate-dependent maintenance of cellular macromolecular synthesis. In addition, this may confer additional protection from oxidative stress due to down-regulation of iron acquisition from transferrin and increased glutamate for glutathione synthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,337
Score d'incertitude au seuil0,800

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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