Notice bibliographique
Résumé
Aim Recent comparisons of different approaches to historical biogeography have suffered in part because Brooks Parsimony Analysis (BPA) has been characterized as a one‐step process following protocols proposed in 1981. Subsequent modifications have resulted in a two‐step methodology. This contribution presents the mechanics and applications of those modifications. Methods The first step, or Primary BPA, which is similar to the original BPA but with modifications proposed by Wiley (1986 , 1988a , b ), is used to assess whether or not there is support for a single general area cladogram. The second step, Secondary BPA, proposed by Brooks (1990) , depicts exceptions to the general area cladogram explicitly by duplicating areas having a reticulate history. Results The analytical basis of area duplication in secondary BPA is explained more fully than in previous accounts, and the manner in which secondary BPA explicitly depicts falsification of the null hypothesis of simple vicariance is presented for four general cases. Main conclusions BPA, as fully implemented, is capable of accounting for the complexity of speciation, dispersal and extinction events in a historical biogeographic context without removing or modifying input data from basic phylogenies, so long as at least three clades are analysed simultaneously to provide a distinction between general and special distribution elements.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,022 | 0,088 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,007 |
| Communication savante | 0,007 | 0,017 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,007 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,039 | 0,041 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».