Identification of the larval and juvenile stages of the Cubera Snapper, Lutjanus cyanopterus, using DNA barcoding
Notice bibliographique
Résumé
The larvae and newly-settled juveniles of the Cubera Snapper, Lutjanus cyanopterus, are identified by DNA barcoding. Four larvae and three small juveniles of L. cyanopterus were detected among a large collection of pelagic larvae and a smaller collection of settled juveniles from the Caribbean coast of Panama. The mtDNA COI barcode sequences from the larvae and juveniles were virtually identical to sequences from adults sampled from the spawning aggregation in St. Thomas, USVI. Barcode sequences for the eleven regional species of Lutjanus species (sensu lato) were obtained and they exhibited deep interspecific divergences that allowed for efficient discrimination among the western Atlantic snapper species. The nearest neighbor species, the Mutton Snapper L. analis, was more than 11% divergent from L. cyanopterus. Cubera Snapper larvae are characterized by prominent melanophores along the outer spinous-dorsal-fin membranes and along the outer third of the longer pelvic-fin membranes. They are morphologically distinct from the late-stage larvae of the other regional snappers by their relatively wider caudal peduncle and their relative dorsal-spine lengths. Juveniles retain the black outer portion of the dorsal and pelvic-fin membranes and have a smaller body-depth than other regional snapper juveniles. The size at settlement is about 18 mm SL, relatively large for lutjanids. Daily otolith increments from L. cyanopterus larvae and juveniles indicate a pelagic larval duration of about 29 days with backcalculated spawning and settlement dates around the new moon. Although smaller adult Cubera Snappers can appear very similar to the Gray Snapper, L. griseus, the larvae and juveniles are quite different. In this case, the early life history stages reflect the deep genetic divergence between the two species while the adult forms converge in appearance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».