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Enregistrement W2120394085 · doi:10.1242/bio.20147583

<i>Smed-dynA-1</i> is a planarian nervous system specific <i>dynamin 1</i> homolog required for normal locomotion

2014· article· en· W2120394085 sur OpenAlexaff
Jared A. Talbot, Ko W. Currie, Bret J. Pearson, Eva‐Maria S. Collins

Notice bibliographique

RevueBiology Open · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlanarian Biology and Electrostimulation
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlanarianDynaminBiologyCell biologyEndocytosisSynaptic vesicleNervous systemGTPaseVesicleRegeneration (biology)NeuroscienceCellGeneticsMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dynamins are GTPases that are required for separation of vesicles from the plasma membrane and thus are key regulators of endocytosis in eukaryotic cells. This role for dynamin proteins is especially crucial for the proper function of neurons, where they ensure that synaptic vesicles and their neurotransmitter cargo are recycled in the presynaptic cell. Here we have characterized the dynamin protein family in the freshwater planarian Schmidtea mediterranea and showed that it possesses six dynamins with tissue specific expression profiles. Of these six planarian homologs, two are necessary for normal tissue homeostasis, and the loss of another, Smed-dynA-1, leads to an abnormal behavioral phenotype, which we have quantified using automated center of mass tracking. Smed-dynA-1 is primarily expressed in the planarian nervous system and is a functional homolog of the mammalian Dynamin I. The distinct expression profiles of the six dynamin genes makes planarians an interesting new system to reveal novel dynamin functions, which may be determined by their differential tissue localization. The observed complexity of neurotransmitter regulation combined with the tools of quantitative behavioral assays as a functional readout for neuronal activity, renders planarians an ideal system for studying how the nervous system controls behavior.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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