Simiate is an Actin binding protein involved in filopodia dynamics and arborization of neurons
Notice bibliographique
Résumé
The Actin cytoskeleton constitutes the functional base for a multitude of cellular processes extending from motility and migration to cell mechanics and morphogenesis. The latter is particularly important to neuronal cells since the accurate functioning of the brain crucially depends on the correct arborization of neurons, a process that requires the formation of several dozens to hundreds of dendritic branches. Recently, a model was proposed where different transcription factors are detailed to distinct facets and phases of dendritogenesis and exert their function by acting on the Actin cytoskeleton, however, the proteins involved as well as the underlying molecular mechanisms are largely unknown. Here, we demonstrate that Simiate, a protein previously indicated to activate transcription, directly associates with both, G- and F-Actin and in doing so, affects Actin polymerization and Actin turnover in living cells. Imaging studies illustrate that Simiate particularly influences filopodia dynamics and specifically increases the branching of proximal, but not distal dendrites of developing neurons. The data suggests that Simiate functions as a direct molecular link between transcription regulation on one side, and dendritogenesis on the other, wherein Simiate serves to coordinate the development of proximal and distal dendrites by acting on the Actin cytoskeleton of filopodia and on transcription regulation, hence supporting the novel model.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».