Phylogeography and evolution of a fungal–insect association on the<scp>T</scp>ibetan<scp>P</scp>lateau
Notice bibliographique
Résumé
Parasitoidism refers to a major form of interspecies interactions where parasitoids sterilize and/or kill their hosts typically before hosts reach reproductive age. However, relatively little is known about the evolutionary dynamics of parasitoidism. Here, we investigate the spatial patterns of genetic variation of Chinese cordyceps, including both the parasitoidal fungus Ophiocordyceps sinensis and its host insects. We sampled broadly from alpine regions on the Tibetan Plateau and obtained sequences on seven fungal and three insect DNA fragments from each of the 125 samples. Seven and five divergent lineages/cryptic species were identified within the fungus and host insects, respectively. Our analyses suggested that O. sinensis and host insects originated at similar geographic regions in southern Tibet/Yunnan, followed by range expansion to their current distributions. Cophylogenetic analyses revealed a complex evolutionary relationship between O. sinensis and its host insects. Significant congruence was found between host and parasite phylogenies and the time estimates of divergence were similar, raising the possibility of the occurrence of cospeciation events, but the incongruences suggested that host shifts were also prevalent. Interestingly, one fungal genotype was broadly distributed, consistent with recent gene flow. In contrast, the high-frequency insect genotypes showed limited geographic distributions. The dominant genotypes from both the fungus and the insect hosts may represent ideal materials from which to develop artificial cultivation of this important Chinese traditional medicine. Our results demonstrate that both historical and contemporary events have played important roles in the phylogeography and evolution of the O. sinensis-ghost moth parasitoidism on the Tibetan Plateau.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».