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Enregistrement W2120521174 · doi:10.1093/jac/dkl494

Role of ABC transporter MRPA,  -glutamylcysteine synthetase and ornithine decarboxylase in natural antimony-resistant isolates of Leishmania donovani

2006· article· en· W2120521174 sur OpenAlexaff
Angana Mukherjee, Parasuraman Padmanabhan, Sushma Singh, Gargi Roy, Isabelle Girard, Mitali Chatterjee, Marc Ouellette, Rentala Madhubala

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensCentre hospitalier de l'Université Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLeishmania donovaniMicrobiologyLeishmaniasisLeishmaniaTransporterBiologyPharmacologyVisceral leishmaniasisOrnithine decarboxylaseEnzymeImmunologyBiochemistryParasite hostingGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The resistance of clinical isolates of Leishmania donovani to sodium antimony gluconate (SAG), the mainstay of treatment in Indian visceral leishmaniasis, has become a critical issue in India. The present work investigates the mechanism of resistance to SAG in parasites isolated from patients who are unresponsive to SAG. METHODS AND RESULTS: Susceptibility to SAG as determined in vitro with intracellular amastigotes correlated well with the clinical response. The ABC transporter gene MRPA was amplified in resistant field isolates as part of an extrachromosomal circle. Co-amplification of the pterin reductase gene (PTR1) and MRPA suggests amplification of the H locus in SAG-resistant isolates. Amplification of MRPA was correlated to increased RNA as determined by real-time PCR. MRPA is an ABC-thiol transporter, and cysteine and glutathione were increased in the resistant isolates. Ornithine decarboxylase (a rate limiting enzyme in polyamine biosynthesis), and gamma-glutamylcysteine synthetase (a rate limiting enzyme in glutathione biosynthesis), the two building blocks of the main cellular thiol trypanothione, were overexpressed in some of the resistant isolates. CONCLUSIONS: A variety of resistance mechanisms to SAG, most of them consistent with a model based on the study of resistance in vitro, were present in clinical isolates from the same geographical region.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations163
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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