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Enregistrement W2120524194 · doi:10.3109/13506129.2015.1070824

Wildlife sequences of islet amyloid polypeptide (IAPP) identify critical species variants for fibrillization

2015· article· en· W2120524194 sur OpenAlexafffund
Jessica S. Fortin, Marie‐Odile Benoit‐Biancamano

Notice bibliographique

RevueAmyloid · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesDiabète Québec
Mots-clésIsletAmyloid (mycology)In silicoAmyloidosisBiologyPeptideGene isoformBiochemistryPathogenesisComputational biologyDiabetes mellitusGeneMedicineImmunologyEndocrinologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amyloid can be detected in the islets of Langerhans in a majority of type 2 diabetic patients. These deposits have been associated with β-cell death, thereby furthering diabetes progression. Islet amyloid polypeptide (IAPP) amyloidogenicity is quite variable among animal species, and studying this variability could further our understanding of the mechanisms involved in the aggregation process. Thus, the general aim of this study was to identify IAPP isoforms in different animal species and characterize their propensity to form fibrillar aggregates. A library of 23 peptides (fragment 8-32) was designed to study the amyloid formation using in silico analysis and in vitro assays. Amyloid formation was impeded when the NFLVH motif found in segment 8-20 was substituted by DFLGR or KFLIR segments. A 29P, 14K and 18R substitution were often present in non-amyloidogenic sequences. Non-amyloidogenic sequences were obtained from Leontopithecus rosalia, Tursiops truncatus and Vicugna pacos. Fragment peptides from 34 species were amyloidogenic. To conclude, this project advances our knowledge on the comparative pathogenesis of amyloidosis in type II diabetes. It is conceivable that the additional information gained may help point towards new therapeutic strategies for diabetes patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,228
Score d'incertitude au seuil0,576

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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