Susceptibility of <i>Streptococcus pneumoniae</i> to Fluoroquinolones in Canada
Notice bibliographique
Résumé
Ciprofloxacin, the first fluoroquinolone to be used to treat lower respiratory tract infections (LRTI), demonstrates poor potency against Streptococcus pneumoniae, and its use has been associated with the emergence of resistance. During the last decade, fluoroquinolones with enhanced in vitro activity against S. pneumoniae have replaced ciprofloxacin for the treatment of LRTI. Here, we analyzed the impact of more active fluoroquinolone usage on pneumococci by examining the fluoroquinolone usage, prevalence of fluoroquinolone resistance, and mutations in the genes that encode the major target sites for the fluoroquinolones (gyrA and parC) in pneumococcal isolates collected in Canada-wide surveillance. A total of 26,081 isolates were collected between 1998 and 2009. During this time period, total per capita outpatient use of fluoroquinolones increased from 64 to 96 prescriptions per 1,000 persons per year. The proportion of prescriptions for respiratory tract infection that were for fluoroquinolones increased from 5.9% to 10.7%, but the distribution changed: the proportion of prescriptions for ciprofloxacin decreased from 5.3% to 0.5%, and those for levofloxacin or moxifloxacin increased from 1.5% in 1999 to 5.9% in 2009. The prevalence of ciprofloxacin resistance (MIC ≥ 4 μg/ml), levofloxacin resistance, and moxifloxacin resistance remained unchanged at <2%. Multivariable analyses showed that prevalence of mutations known to be associated with reduced susceptibility to fluoroquinolones did not change during the surveillance period. If fluoroquinolone therapy is required, the preferential use of fluoroquinolones with enhanced pneumococcal activity to treat pneumococcal infections may slow the emergence of resistance in S. pneumoniae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».