MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2120731606 · doi:10.1111/j.0014-3820.2005.tb01013.x

COLONIZATION, DISPERSAL, AND HYBRIDIZATION INFLUENCE PHYLOGEOGRAPHY O NORTH ATLANTIC SEA URCHINS (STRONGYLOCHNTROTUS DROEBACHIENSIS)

2005· article· en· W2120731606 sur OpenAlexaff
Jason A. Addison, Michael W. Hart

Notice bibliographique

RevueEvolution · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBiological dispersalCoalescent theoryGene flowPopulationPhylogeographyLast Glacial MaximumEcologyIntrogressionPopulation geneticsGlacial periodGenetic variationGeneticsPhylogeneticsDemographyGenePaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We used frequency-based and coalescent-based phylogeographic analysis of sea urchin (Strongylocentrotus droebachiensis) mitochondrial DNA (mtDNA) sequences and previously published microsatellite data to understand the relative influence of colonization and gene flow from older (north Pacific) and younger (northeast Atlantic) sea urchin populations on genetic variation in the northwest Atlantic. We found strong evidence of survival of northwestern Atlantic populations in local Pleistocene glacial refugia: most haplotypes were the same as or closely related to Pacific haplotypes, with deep gene genealogies that reflect divergence times within the northwestern Atlantic that are much older than the last glacial maximum. We detected gene flow across the North Atlantic in the form of haplotypes shared with or recently descended from European populations. We also found evidence of significant introgression of haplotypes from a closely related species (S. pallidus). The relative magnitude of gene flow estimated by coalescent methods (and the effective population size differences among oceanic regions) depended on the genetic marker used. In general, we found very small effective population size in the northeastern Atlantic and high trans-Arctic gene flow between the Pacific and northwestern Atlantic. Both analyses suggested significant back-migration to the Pacific. However, microsatellites more strongly reflected older Pacific migration (with similar effective population sizes across the Arctic), whereas mtDNA sequences appeared to be more sensitive to recent trans- Atlantic dispersal (with larger differences in effective population size). These differences across marker types might have several biological or methodological causes, and they suggest caution in interpretation of the results from a single locus or class of markers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,170
Écart entre enseignants0,166 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations87
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEvolutionMême sujetMarine and coastal plant biologyTravaux en français237 207