COLONIZATION, DISPERSAL, AND HYBRIDIZATION INFLUENCE PHYLOGEOGRAPHY O NORTH ATLANTIC SEA URCHINS (STRONGYLOCHNTROTUS DROEBACHIENSIS)
Notice bibliographique
Résumé
We used frequency-based and coalescent-based phylogeographic analysis of sea urchin (Strongylocentrotus droebachiensis) mitochondrial DNA (mtDNA) sequences and previously published microsatellite data to understand the relative influence of colonization and gene flow from older (north Pacific) and younger (northeast Atlantic) sea urchin populations on genetic variation in the northwest Atlantic. We found strong evidence of survival of northwestern Atlantic populations in local Pleistocene glacial refugia: most haplotypes were the same as or closely related to Pacific haplotypes, with deep gene genealogies that reflect divergence times within the northwestern Atlantic that are much older than the last glacial maximum. We detected gene flow across the North Atlantic in the form of haplotypes shared with or recently descended from European populations. We also found evidence of significant introgression of haplotypes from a closely related species (S. pallidus). The relative magnitude of gene flow estimated by coalescent methods (and the effective population size differences among oceanic regions) depended on the genetic marker used. In general, we found very small effective population size in the northeastern Atlantic and high trans-Arctic gene flow between the Pacific and northwestern Atlantic. Both analyses suggested significant back-migration to the Pacific. However, microsatellites more strongly reflected older Pacific migration (with similar effective population sizes across the Arctic), whereas mtDNA sequences appeared to be more sensitive to recent trans- Atlantic dispersal (with larger differences in effective population size). These differences across marker types might have several biological or methodological causes, and they suggest caution in interpretation of the results from a single locus or class of markers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».