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Enregistrement W2120757204 · doi:10.1074/jbc.m410171200

H3 Domain of Syntaxin 1A Inhibits KATP Channels by Its Actions on the Sulfonylurea Receptor 1 Nucleotide-Binding Folds-1 and -2

2004· article· en· W2120757204 sur OpenAlexafffund
Ningren Cui, Youhou Kang, Yan He, Yuk‐Man Leung, Huanli Xie, Ewa A. Pasyk, Xiao‐Dong Gao, Laura Sheu, John Bondo Hansen, Philip Wahl, Robert G. Tsushima, Herbert Y. Gaisano

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Association of GastroenterologyHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésSulfonylurea receptorSulfonylureaChemistryNucleotideCell biologyBiologyBiochemistryEndocrinologyInsulinGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ATP-sensitive potassium (K(ATP)) channel in pancreatic islet beta cells consists of four pore-forming (Kir6.2) subunits and four regulatory sulfonylurea receptor (SUR1) subunits. In beta cells, the K(ATP) channel links intracellular metabolism to the dynamic regulation of the cell membrane potential that triggers insulin secretion. Syntaxin 1A (Syn-1A) is a SNARE protein that not only plays a direct role in exocytosis, but also binds and modulates voltage-gated K(+) and Ca(2+) channels to fine tune exocytosis. We recently reported that wild type Syn-1A inhibits rat islet beta cell K(ATP) channels and binds both nucleotide-binding folds (NBF-1 and NBF-2) of SUR1. However, wild type Syn-1A inhibition of rat islet beta cell K(ATP) channels seems to be mediated primarily via NBF-1. During exocytosis, Syn-1A undergoes a conformational change from a closed form to an open form, which would fully expose its active domain, the C-terminal H3 domain. Here, we show that the constitutively open form Syn-1A mutant (L165A/E166A) has a similar affinity to NBF-1 and NBF-2 as wild type Syn-1A and was equally effective in inhibiting the K(ATP) channels of rat pancreatic beta cells and a cell line (BA8) stably expressing SUR1/Kir6.2. Although dialysis of NBF-1 into BA8 and islet beta cells effectively blocked wild type and open form Syn-1A inhibition of the K(ATP) current, NBF-2 was also effective in blocking the open form Syn-1A inhibition. This prompted us to examine the specific domains within Syn-1A that would mediate its action on the K(ATP) channels. The C-terminal H3 domain of Syn-1A (Syn-1A-H3), but not the N-terminal H(ABC) domain (Syn-1A-H(ABC)), binds the SUR1 protein of BA8 cells, causing an inhibition of K(ATP) currents, and this inhibition was mediated via both NBF-1 and NBF-2. It therefore appears that the H3 domain of Syn-1A is the putative domain, which binds SUR1, but its distinct actions on the NBFs may depend on the conformation of Syn-1A occurring during exocytosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,353

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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