MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2120770288 · doi:10.1099/mic.0.053082-0

Stringent response mutants of Pseudomonas chlororaphis PA23 exhibit enhanced antifungal activity against Sclerotinia sclerotiorum in vitro

2011· article· en· W2120770288 sur OpenAlexaff
Jerrylynn Manuel, Carrie Selin, W. G. Dilantha Fernando, Teresa de Kievit

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésrpoSPseudomonas chlororaphisSclerotinia sclerotiorumMutantBiologyMicrobiologyStringent responseBiochemistryChemistryGene expressionPseudomonasBacteriaPromoterGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The stringent response (SR) is a regulatory mechanism that enables bacteria to adapt to nutrient stress through the production of the alarmone (p)ppGpp. The aim of the current study was to understand how the SR affects the antifungal (AF) activity of Pseudomonas chlororaphis PA23. Two SR mutants were generated, PA23relA and PA23relAspoT, that no longer produced (p)ppGpp. Both mutants exhibited increased inhibition of Sclerotinia sclerotiorum in vitro and elevated pyrrolnitrin (PRN), lipase and protease production. Phenazine (PHZ) levels, on the other hand, remained unchanged. Through transcriptional fusion analysis we discovered that prnA-lacZ (PRN) activity was increased in the SR mutants, whereas phzA-lacZ (PHZ) activity was equal to that of the wild-type. We also examined how the sigma factor RpoS impacts PA23-mediated antagonism. Similar to the SR mutants, an rpoS mutant of PA23, called PA23rpoS, exhibited enhanced AF activity in vitro and increased expression of PRN, protease and lipase. However, PHZ production and expression of phzA-lacZ were dramatically reduced. Consistent with what has been reported for other bacteria, the SR exerted positive control over rpoS expression. In addition, providing rpoS in trans restored the SR phenotype to that of the wild-type. Collectively, our findings indicate that this global stress response impacts production of PA23 AF compounds via regulation of rpoS transcription and has an overall negative influence on S. sclerotiorum antagonism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,259
Score d'incertitude au seuil0,642

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicrobiologyMême sujetPlant-Microbe Interactions and ImmunityTravaux en français237 207